物业应通过以下方式处理小区超时施工问题：

1. 核实施工合法性
   首先需确认施工方是否持有合法手续，包括《建筑工程施工许可证》《夜间施工许可证》（如涉及夜间作业）等。若施工方无证施工或超范围施工，物业有权要求其立即停工，并向城管执法部门或环保部门举报。

2. 依据管理规约约束
   根据《物业管理条例》及小区《管理规约》，物业可制定施工时间规则（如工作日8:00-18:00，周末及节假日禁止噪音施工）。若施工方违反规定，物业应书面警告并要求整改，逾期未改可采取暂停水电供应（需提前公告）或限制施工车辆进出等措施。

3. 协调沟通与公示
   物业需组织业主代表与施工方协商，明确施工期限及降噪方案（如安装隔音屏障、使用低噪音设备）。同时，通过公告栏、业主群等渠道定期公示施工进度及投诉渠道，避免信息不对称引发矛盾。

4. 行政投诉与法律途径
   若施工方拒不配合，物业可向当地环保部门投诉噪音污染（依据《环境噪声污染防治法》），或向住建部门举报违规施工。必要时，物业可协助业主以“相邻权纠纷”为由起诉施工方，要求停止侵害并赔偿损失。

关键提醒：物业需保留施工方违规证据（如噪音检测报告、视频记录、书面通知等），以便后续维权。若问题复杂，可直接向我咨询具体操作流程。