分公司的合同签字人是公司法定代表人时，合同是否有效需分情况讨论，具体分析如下：
一、分公司获总公司明确授权时，法定代表人签字有效
根据《公司法》及相关司法实践，分公司虽不具有独立法人资格，但经总公司书面授权后，可在授权范围内以自己名义对外签订合同。此时：
- 签字主体合法性：若合同相对方未明确要求总公司法定代表人签字，分公司负责人（通常为分公司法定代表人）在授权范围内签署的合同具有法律效力。
- 责任承担：合同权利义务由总公司承继，分公司不独立承担责任。例如，分公司与供应商签订采购合同，若获总公司授权，供应商可要求总公司履行合同义务。
法律依据：
《公司法》第十四条规定，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。实践中，总公司可通过授权书明确分公司的签约权限，使合同生效。
二、分公司未获授权或超出授权范围时，合同效力待定
若分公司未经总公司授权，或超出授权范围签订合同，则需分情况处理：
- 效力待定状态：此时合同并非当然无效，而是处于效力待定状态。若总公司在合理期限内（通常为一个月）追认，合同有效；若拒绝追认，则合同无效。
- 相对方催告权：根据《民法典》相关规定，相对方可催告总公司在30日内追认。未作表示的，视为拒绝追认。
示例：
分公司未经授权与第三方签订技术转让合同，若总公司在收到催告后未追认，则合同无效，分公司需承担缔约过失责任。
三、合同相对方要求总公司法定代表人签字时的处理
若合同相对方明确要求总公司法定代表人签字，则分公司负责人签字可能被认定为不符合形式要件。此时：
- 合同效力风险：若未满足相对方要求，可能引发合同效力争议。例如，在重大交易中，相对方可能以签字主体不符为由主张合同未成立。
- 解决方案：总公司可出具授权委托书，明确分公司负责人代为签字的权限，或直接由总公司法定代表人签字。
法律建议
- 完善授权手续：总公司应向分公司出具书面授权书，明确签约权限、范围及期限，避免效力争议。
- 合同条款设计：在合同中明确签字主体的合法性，例如约定“分公司负责人签字视为总公司授权行为”。
- 风险防范：分公司签订合同前，应核实相对方是否对签字主体有特殊要求，必要时提前与总公司沟通。
总结：分公司合同由法定代表人签字是否有效，核心在于是否获得总公司授权。建议企业在操作中严格遵循授权流程，确保合同效力。如有具体案件或授权文件需要审查，可直接向我咨询。