结论前置：

1. 网上起诉离婚立案后，原则上不影响双方去民政局协议离婚，但需注意法律程序和实际操作中的问题。
2. 若法院已正式受理并进入审理程序，建议优先通过诉讼程序解决，避免程序冲突。

详细分析：

一、法律程序上的可能性

1. 协议离婚与诉讼离婚并行不悖
   根据《民法典》第1076条，协议离婚需双方自愿并签订书面协议，到民政局办理登记。而诉讼离婚是单方通过法院解除婚姻关系。两者在法律上属于独立程序，立案后未进入实质审理阶段时，双方仍可协商一致去民政局办理离婚。

2. 实际操作中的风险

   • 程序冲突：若法院已向对方送达诉讼材料，或已安排开庭，此时突然协议离婚可能导致诉讼程序终止，但需向法院提交撤诉申请，否则可能浪费司法资源。
     
   • 财产分割矛盾：诉讼中可能涉及财产调查、证据固定，若协议离婚时未妥善处理，后续可能因财产问题引发新纠纷。

二、诉讼程序进展的影响

1. 立案后未开庭
   若仅完成网上立案，法院尚未正式受理（如未缴纳诉讼费、未送达对方），双方可随时协商去民政局离婚。但需注意：协议离婚后应立即向法院申请撤诉，避免程序重复。

2. 已进入审理阶段
   若法院已受理并安排开庭，此时协议离婚需谨慎：

   • 法院可能要求撤诉：协议离婚后，法院会以“双方已自行解决纠纷”为由终结诉讼，但需提交离婚证作为证据。
     
   • 子女抚养/财产分割差异：若协议内容与诉讼主张不一致（如抚养费、财产分配），可能引发后续争议，建议统一处理方式。

三、实务建议

1. 优先选择一种程序

   • 若双方矛盾不深，建议直接协议离婚（程序快、成本低）。
     
   • 若存在争议（如财产隐蔽、一方不同意离婚），建议通过诉讼彻底解决，避免协议离婚后反悔。

2. 及时沟通法院
   若已立案又想协议离婚，务必联系法院说明情况，避免因未撤诉被强制判决，导致协议离婚无效。

总结：网上起诉离婚立案后，双方仍可去民政局协议离婚，但需根据诉讼程序进展决定是否撤诉，并确保协议内容与诉讼主张一致。如有复杂财产或子女问题，建议通过诉讼一次性解决，减少后续风险。