虚开增值税专用发票金额达5000万，公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员将面临严重的刑事处罚，公司注销并不能逃避这一法律责任。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律责任角度
刑事责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；虚开的税款数额较大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；虚开的税款数额巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
- 在您提到的案例中，虚开增值税专用发票金额达5000万，显然属于“数额巨大”或“有其他特别严重情节”的情形，因此公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产的严厉处罚。
公司注销与法律责任：
- 公司注销并不意味着其法律责任的消失。特别是当公司涉及刑事犯罪时，即使公司已经注销，其直接负责的主管人员和其他直接责任人员仍然需要承担相应的刑事责任。
- 此外，如果公司注销是为了逃避刑事处罚或支付巨额罚金，这种行为可能被视为恶意注销，检察机关和相关执法部门有权采取措施恢复公司法人资格，并将其列为被告进行追诉。
二、实际操作角度
公司注销的合法程序：
- 根据我国公司法等相关规定，公司注销需要经过清算程序，包括成立清算组、通知债权人、清理公司财产、支付工资和税收、偿还债务等步骤。
- 如果公司存在税务异常、证照不齐、缺少账簿或分公司/子公司未注销等情况，是不能直接申请注销的。
恶意注销的后果：
- 恶意注销公司行为会严重破坏营商环境，侵害国家利益、社会公共利益和其他债权人合法权益。
- 检察机关在履职过程中会加大对恶意注销公司行为的关注，并采取相应措施进行防范和打击。例如，告知犯罪嫌疑人不得恶意注销公司、通知公司登记部门暂停办理公司注销登记、牵头有关部门会商会办堵塞漏洞等。
三、建议与措施
对于公司而言：
- 应严格遵守税收法律法规，避免虚开增值税专用发票等违法行为。
- 如果公司确实存在经营困难或需要解散的情况，应依法进行清算和注销程序，不得恶意注销以逃避法律责任。
对于个人而言：
- 作为公司的直接负责的主管人员或其他直接责任人员，应增强法律意识，避免参与或纵容公司的违法行为。
- 如果发现公司存在虚开增值税专用发票等违法行为，应及时向相关部门举报并配合调查。
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