结论前置：
- 一般情况下，夫妻分居期间一方将工资存为死期，银行不会因此扣掉该款项。
- 但如果该款项涉及共同债务或法院判决、裁定要求支付，则可能面临被扣划的风险。
详细分析：
首先，我们需要明确的是，夫妻分居并不等同于离婚。在分居期间，夫妻双方的财产关系仍然受到婚姻法的调整（此处指现行有效的《中华人民共和国民法典》中关于婚姻家庭的规定）。工资作为夫妻共同财产的一部分（除非有特别约定），在分居期间仍然属于夫妻共同所有。
关于工资存为死期是否会被扣掉的问题：
银行角度：
- 银行作为金融机构，其业务操作主要遵循与客户的合同约定以及相关法律法规。在客户没有违反合同约定或法律法规的情况下，银行无权单方面扣划客户的存款。
- 因此，如果一方将工资存为死期，且没有涉及任何违法或违约行为，银行是不会因此扣掉该款项的。
法律角度：
- 在夫妻分居期间，如果一方将工资存为死期，且该款项不属于共同债务的支付范围，那么该款项通常不会被扣划。
- 但是，如果该款项涉及共同债务（如夫妻共同贷款、共同担保等），且债权人通过法律途径要求支付，那么法院可能会判决或裁定从该存款中扣划相应金额以偿还债务。
- 另外，如果法院在离婚诉讼或其他相关诉讼中判决或裁定一方需要支付特定金额给另一方，且该一方未履行支付义务，法院也可能通过执行程序从该一方的存款中扣划相应金额。
特殊情况下的处理：
- 如果夫妻双方有特别约定，如分居期间各自财产独立等，那么该约定可能对工资存款的处理产生影响。但这种情况需要具体分析约定内容以及是否符合法律法规的规定。
- 如果涉及家庭暴力、遗弃等违法行为，受害方可能通过法律途径要求赔偿，此时也可能涉及存款的扣划问题。
建议：
- 在夫妻分居期间，建议双方保持沟通，明确财产的处理方式，避免不必要的纠纷。
- 如果涉及共同债务或法律纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
- 对于工资等财产的处理，建议遵循法律法规的规定以及双方的约定，确保合法合规。
后续行动指南：
- 如果您或您的配偶在分居期间将工资存为死期，并担心可能被扣划，建议先了解该款项是否涉及共同债务或法律纠纷。
- 如果涉及相关问题，建议及时咨询我或其他专业律师，以便得到更具体的法律建议和指导。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。