融资收付款由第三方代收是合法的，但前提是要符合相关法律法规的规定。具体分析如下：

一. 民法层面的合法性

1. 意思自治原则：根据《民法典》第五百二十二条和第五百二十三条的规定，债务人可以向第三人履行债务，也可以由第三人向债权人履行债务。只要各方当事人对债务履行方式达成协商一致，无论是代收款还是代付款行为，都符合法律规定，不会存在法律风险。这体现了民法中的意思自治原则，即尊重当事人的自主意愿。

二. 税法层面的注意事项

1. 发票开具规定：根据《发票管理办法》及其实施细则，发票应由实际经营业务一方开具。如果第三方只是代收款，并未实际经营业务，那么由第三方开具发票将存在虚开发票的风险。因此，在融资收付款过程中，应确保发票由实际提供服务的一方开具。

三. 建筑领域的特殊规定

1. 内部授权或三方协议：在建筑领域，存在特殊规定。根据《国家税务总局关于进一步明确营改增有关征管问题的公告》，建筑企业与发包方签订建筑合同后，可以内部授权或者三方协议等方式，授权集团内其他纳税人提供建筑服务，并由第三方缴纳增值税并向发包方开具增值税发票。这一规定为建筑领域的第三方代收款项提供了合法性依据。

四. 实际操作中的建议

1. 确保合法性：在融资收付款过程中，应确保各方当事人的行为符合法律法规的规定，避免涉及非法活动。
2. 明确协议内容：建议各方签订明确的协议，约定代收款项的具体事项、金额、期限等，以确保权益得到保障。
3. 咨询专业人士：如有需要，可以咨询专业的律师或税务师，以确保融资收付款过程的合法性和合规性。

综上所述，融资收付款由第三方代收是合法的，但应遵守相关法律法规的规定，并确保发票由实际提供服务的一方开具。同时，建议各方签订明确的协议，并咨询专业人士以确保合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。