结论前置：办理农村自建房买卖并委托他人代理的公证书，需准备以下资料：

1. 基础身份与产权证明

   • 父亲（卖方）与儿子（买方）的身份证原件及复印件；
     
   • 农村自建房的《集体土地使用证》或《宅基地使用权证》原件及复印件（需确认房屋产权无争议）；
     
   • 若房屋已办理房产证（如适用），需提供房产证原件及复印件。

2. 委托代理相关材料

   • 父亲签署的《授权委托书》（需明确委托事项、权限及期限，建议由公证处提供模板）；
     
   • 代理人的身份证原件及复印件（若代理人非儿子本人，需额外提供代理人身份证明）；
     
   • 父亲与代理人的关系证明（如户口本、亲属关系公证书等，若适用）。

3. 买卖合同及补充文件

   • 父亲与儿子签订的《农村房屋买卖合同》（需明确房屋位置、面积、价格、付款方式等条款）；
     
   • 若涉及宅基地使用权转让，需提供村委会出具的同意转让证明（部分地区要求）；
     
   • 房屋现状照片或视频（可选，用于辅助证明房屋情况）。

4. 其他可能需要的材料

   • 父亲与儿子的婚姻状况证明（如离婚证、结婚证等，若涉及财产分割）；
     
   • 若房屋为共有财产（如父亲与母亲共有），需提供其他共有人同意出售的书面声明；
     
   • 公证处要求的其他补充材料（如询问笔录、声明书等）。

注意事项：

• 农村自建房买卖需符合当地政策（如宅基地使用权转让限制），建议提前咨询当地国土部门或村委会；
  
• 公证处可能对材料格式、签字真实性等有严格要求，建议提前与公证员沟通确认；
  
• 若涉及大额交易，可考虑同步办理资金监管或提存公证，降低风险。
  

如有其他细节问题（如合同条款、税费计算等），可直接向我咨询。