在电动车与无证摩托车相撞，且电动车负主责、摩托车负次责的情况下，救助基金的偿还责任需根据具体情况来确定。以下是从不同角度进行的分析：
一、救助基金的基本性质与用途
救助基金，通常指的是道路交通事故社会救助基金，其设立的主要目的是为了救助在道路交通事故中受到伤害但无法及时获得赔偿的受害人。这笔资金一般用于垫付受害人的医疗费用、丧葬费用等紧急支出。
二、责任划分与偿还原则
主次责任划分：
- 在本案例中，电动车负主责，意味着电动车驾驶员在事故中存在较大的过错，应承担主要的赔偿责任。
- 摩托车负次责，则表明摩托车驾驶员在事故中也有一定的过错，但过错程度相对较小。
偿还原则：
- 救助基金垫付后，其偿还责任通常与事故责任划分相关联。即，主要责任方应承担更多的偿还责任，次要责任方则承担较少的偿还责任。
- 具体偿还比例可能因地区、政策或具体案件情况而有所不同，但一般原则是“按责分担”。
三、具体偿还情况分析
若救助基金仅垫付了电动车驾驶员的费用：
- 由于电动车负主责，因此电动车驾驶员应承担大部分或全部的偿还责任。
- 摩托车驾驶员作为次要责任方，可能不需要直接偿还救助基金，但可能在电动车驾驶员无法全额偿还时，根据法院判决或调解协议承担一定的补充责任。
若救助基金垫付了双方驾驶员的费用：
- 偿还责任应按照主次责任进行划分。电动车驾驶员作为主要责任方，应承担更多的偿还责任；摩托车驾驶员作为次要责任方，承担较少的偿还责任。
- 具体偿还比例可能需要根据双方的实际损失、过错程度以及救助基金的垫付情况等因素进行综合判断。
特殊情况下的偿还责任：
- 如果电动车驾驶员或摩托车驾驶员存在故意或重大过失导致事故发生，且这种故意或重大过失与救助基金的垫付有直接关联，那么相关驾驶员可能需要承担全部的偿还责任。
- 如果事故是由于不可抗力或第三方原因导致的，且救助基金的垫付与这些因素无直接关联，那么偿还责任可能需要根据具体情况进行协商或判决。
四、法律建议与后续行动
及时沟通与协商：
- 事故发生后，双方驾驶员应及时与救助基金管理机构沟通，了解垫付情况和偿还要求。
- 双方可以尝试通过协商达成偿还协议，明确各自的偿还责任和比例。
依法处理与诉讼：
- 如果协商不成，双方可以依法向人民法院提起诉讼，由法院根据事故责任划分、救助基金垫付情况等因素判决偿还责任。
- 在诉讼过程中，双方应提供充分的证据支持自己的主张，如事故认定书、医疗费用单据、救助基金垫付证明等。
遵守法律判决与履行义务：
- 无论协商还是诉讼，双方都应遵守最终的判决或协议，按时履行偿还义务。
- 如果一方不履行偿还义务，另一方可以依法向人民法院申请强制执行。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。