可以要求对方赔偿，但能否获得赔偿取决于能否证明事故与身体问题之间的因果关系以及责任划分。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律责任基础
根据《中华人民共和国民法典》侵权责任编的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在摩托车碰撞事故中，如果对方存在过错（如违反交通规则、未保持安全距离等），且该过错与您两天后发现的身体问题存在因果关系，那么对方应当承担相应的赔偿责任。
二、因果关系证明
及时就医与诊断：
- 事故发生后，即使当时未感觉明显不适，也应尽快就医检查。两天后发现身体问题，应立即前往医院进行诊断，并保留好所有医疗记录、诊断证明和费用单据。
- 医疗记录是证明事故与身体问题之间因果关系的关键证据。医生会根据您的症状和检查结果，出具诊断意见，明确身体问题是否与事故有关。
专业鉴定：
- 如果对方对因果关系提出异议，您可能需要申请专业鉴定机构进行因果关系鉴定。鉴定机构会结合您的医疗记录、事故现场情况等因素，出具鉴定意见。
- 鉴定意见具有较高的证明力，是法院认定因果关系的重要依据。
三、责任划分与赔偿范围
责任划分：
- 事故责任通常由交警部门根据事故现场情况、当事人陈述、证人证言等证据进行划分。如果对方承担全部或主要责任，那么您有权要求对方承担相应的赔偿责任。
- 如果您也存在一定过错（如未佩戴安全头盔、超速行驶等），那么您的赔偿责任可能会相应减轻。
赔偿范围：
- 赔偿范围通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。如果身体问题构成伤残，还可以要求赔偿残疾赔偿金、精神损害抚慰金等。
- 具体赔偿金额需要根据您的实际损失和对方的责任比例进行计算。
四、实际操作建议
收集证据：
- 除了医疗记录外，还应收集事故现场照片、视频、证人证言等证据，以证明事故发生经过和对方的过错。
- 如果可能，可以请交警部门出具事故责任认定书，作为后续索赔的依据。
协商与调解：
- 在证据充分的情况下，可以尝试与对方进行协商，达成赔偿协议。如果协商不成，可以申请交警部门或人民调解委员会进行调解。
诉讼途径：
- 如果调解无果，您可以向法院提起诉讼，要求对方承担赔偿责任。在诉讼过程中，应提供充分的证据证明事故与身体问题之间的因果关系以及对方的过错。
五、注意事项
- 时效性：请注意诉讼时效问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，您应及时行使权利，避免超过诉讼时效。
- 专业咨询：在处理此类纠纷时，建议您咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。
总结来看，摩托车发生碰撞后过了两天发现身上有问题，您可以要求对方赔偿。但能否获得赔偿取决于能否证明事故与身体问题之间的因果关系以及责任划分。因此，建议您及时就医、收集证据，并在必要时咨询专业律师的意见。