在单位脑干出血昏迷是否算工伤，需依据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
一、可认定为工伤的情形
工作原因直接导致：
- 若脑干出血是由于工作环境的恶劣条件（如极端高温、高压环境）、工作强度过大（如长时间连续加班、高强度体力劳动）或外部物理伤害（如头部撞击）等直接因素导致，且能够证明脑干出血与工作之间存在直接的因果关系，那么根据《工伤保险条例》的相关规定，这种情况应当认定为工伤。
视同工伤的情形：
- 根据《工伤保险条例》第十五条第（一）项规定，即使脑干出血不是直接由工作原因导致的，但如果满足以下条件，也可被视同为工伤：在工作时间和工作岗位，突发疾病（包括脑干出血）并在48小时之内经抢救无效死亡的。这种情况下，其近亲属能够按照规定从工伤保险基金领取丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金。
二、不可认定为工伤的情形
自身疾病非工作因素诱发：
- 若脑干出血主要由职工自身的基础性疾病（如高血压、脑血管畸形等）引起，且这些疾病的发作与工作无直接关联，特别是在非工作时间或虽在工作时间内但非因工作原因诱发时，这种情况一般不被认定为工伤。
超过48小时未死亡的情况：
- 即使脑干出血发生在工作时间和工作岗位上，但如果职工在48小时后仍然存活，且没有其他可认定为工伤的情形（如工作原因直接导致），那么一般不能视同工伤。
三、申请工伤认定的流程与建议
提出申请：
- 用人单位应在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起30日内，向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若用人单位未按时申请，工伤职工或其近亲属、工会组织可在一年内直接向相关部门提出申请。
提交材料：
- 申请时需提交工伤认定申请表、与用人单位的劳动关系证明材料（如劳动合同、工资记录等），以及医疗诊断证明或职业病诊断证明书。对于脑干出血的情况，还需提供详细的医学鉴定报告，以证明脑干出血与工作之间的因果关系（如适用）。
建议与指导：
- 在处理单位脑干出血是否算工伤的问题时，建议进行详细的调查和医学鉴定，以确保公正、合理地认定工伤。如果您或您身边的人遇到了类似的情况，应尽快咨询我，进行具体评估和处理，以便及时维护自己的合法权益。
总结来说，在单位脑干出血昏迷是否算工伤，取决于脑干出血的原因、发生的时间地点以及与工作的关联程度。在处理此类问题时，务必进行详细的调查和医学鉴定，并遵循规定的申请流程。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。