在涉及贩毒的案件中，关于没有实质性证据时如何指控及定罪的问题，这实际上是一个关于刑事诉讼中证据原则和法律程序的重要议题。
首先，我们要明确的是，在刑事诉讼中，证据是定罪量刑的基石。没有确凿、充分的证据，法院是不能对被告人进行定罪量刑的。这一点在《中华人民共和国刑事诉讼法》中有明确的规定，即对所有案件的判处都必须重视证据和调查研究，不轻信口供。仅凭被告人供述而无其他证据，不能认定其有罪；即便没有被告人供述，但证据确实、充分，仍可认定其有罪并处以刑罚。
对于贩毒案件，证据的确实、充分需要满足几个关键条件：
定罪量刑的事实均有证据证明：这意味着每一个与案件相关的关键事实，如毒品的来源、交易过程、数量等，都需要有相应的证据来支持。
定案证据均经法定程序查证属实：证据必须是通过合法的侦查、取证程序获得的，并且经过法庭的质证和认证，确保其真实性和合法性。
综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑：这是指法庭在审理案件时，需要综合考虑所有证据，确保所认定的事实没有合理的怀疑空间。
如果贩毒案件中没有实质性证据，或者证据存在重大瑕疵，无法达到上述的证明标准，那么根据“疑罪从无”的原则，法院应作出无罪判决。这一原则体现了刑事诉讼中保护人权和确保司法公正的重要性，它避免了仅凭怀疑或推测就对被告人进行定罪的情况。
当然，如果后续发现了新的证据，或者原有证据得到了进一步的补充和完善，足以证明被告人的贩毒行为，那么检察机关可以再次提起公诉，法院也将依法对新提交的证据进行审理，并根据证据情况作出相应的判决。
总的来说，在贩毒案件中，没有实质性证据是不能指控被告人有罪的。这是我国刑事诉讼制度的基本原则，也是保障公民合法权益、维护司法公正的重要体现。在处理此类案件时，我们必须严格遵守法律规定，确保每一步都合法、合规。