同一份判决书中的原告被告相互赔偿款，在法律上是可以进行抵扣的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律原则与规定

在民事诉讼中，当判决书确定原告和被告均负有向对方支付赔偿款的义务时，从法律公平和效率的角度出发，允许进行相互抵扣是合理的。这种抵扣实际上是一种债务的抵销，即双方互负债务时，各以其债权充当债务的清偿，而使其债务与对方的债务在对等额内相互消灭。

二、抵扣的法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》的相关规定：
   • 第五百六十八条规定：“当事人互负债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定不得抵销的除外。”
   • 第五百六十九条规定：“当事人互负债务，标的物种类、品质不相同的，经协商一致，也可以抵销。”

这两条规定为同一份判决书中的原告被告相互赔偿款进行抵扣提供了明确的法律依据。只要双方互负的债务在种类和品质上相同，或者经协商一致可以抵销，就可以进行抵扣。

1. 司法实践中的操作：
   • 在司法实践中，法院在执行判决时，如果发现原告和被告均负有赔偿义务，且赔偿款的种类和品质相同，通常会主动询问双方是否同意进行抵扣。如果双方同意，法院会直接在执行过程中进行抵扣，以简化执行程序，提高执行效率。

三、抵扣的具体操作与注意事项

1. 抵扣的具体操作：

   • 在判决书生效后，原告和被告可以自行协商抵扣事宜，并达成书面协议。
   • 如果双方无法自行协商，可以在执行过程中向法院提出抵扣申请。法院在审查后，如果认为符合抵扣条件，会依法进行抵扣。

2. 注意事项：

   • 抵扣前应确保双方互负的债务是真实存在的，且已经法院判决确认。
   • 抵扣的金额应准确计算，避免出现误差或遗漏。
   • 如果双方对抵扣事宜有争议，应及时通过法律途径解决，以免影响判决的执行。

四、特殊情况下的处理

在某些特殊情况下，如一方当事人对判决结果有异议并提起上诉，或者判决涉及多个法律关系和多个当事人时，抵扣的处理可能会更加复杂。此时，应根据具体情况和法律规定进行判断和处理。

建议：在实际操作中，如果原告和被告对相互赔偿款的抵扣有疑问或争议，可以及时咨询专业律师（即向我咨询），以确保自身权益得到妥善维护。