结论前置：按了手印但没有盖章的协议，在符合一定条件下是有效的。不过，其有效性还需根据协议的具体内容、双方的真实意思表示以及相关法律法规进行综合判断。
协议有效性的法律基础
《民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同时，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，签名、盖章、按指印在合同成立上具有同等的法律效力。
- 同时，《民法典》第五百零二条规定，依法成立的合同，自成立时生效，除非法律另有规定或当事人另有约定。
协议有效性的核心要素：
- 行为人具有相应的民事行为能力：签订协议的双方必须具备独立实施民事法律行为的能力。
- 意思表示真实：双方在签订协议过程中必须表达其内心真实意愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 不违反法律法规与公序良俗：协议内容必须符合法律和行政法规的规定，不能损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。
具体分析
按手印的法律效力：
- 在一些简单的民间交易中，双方当事人可能因各种原因无法盖章，但通过按手印的方式来表明对交易内容的认可。这种情况下，手印可作为确认合同效力的依据之一。
- 手印在法律上具有与签字同等的效力，能表明当事人对协议内容的认可。
存在瑕疵的情况：
- 尽管按手印具有一定的法律效力，但仅有人手印而无盖章，在证明合同真实性及双方合意方面可能存在不足。
- 若合同明确约定必须盖章才生效，或者某些特定法律领域规定盖章是生效要件，那仅有手印就可能使合同效力存疑。例如，一些涉及重大财产交易或特定行业的合同。
实际认可情况：
- 若双方在协议履行过程中都认可协议效力，且未因盖章问题产生争议，法院通常也会认定协议有效。
- 只要协议内容不违反法律法规的强制性规定，不存在欺诈、胁迫等可撤销情形，仅有手印的协议对双方当事人就具有拘束力，双方应依约履行各自义务。
案例分析
假设甲和乙签订了一份借款协议，双方仅在协议上按了手印而没有盖章。后甲以协议没有盖章为由主张协议无效并拒绝履行还款义务。在此情况下，如果甲和乙均具有相应的民事行为能力，签订协议是双方真实意思的表示，且协议内容不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么法院通常会认定该借款协议有效。因为按手印和盖章在合同成立上具有同等的法律效力。
建议
增强协议效力：
- 为避免可能出现的纠纷，建议在签订重要协议时尽量同时采用签名、盖章和按手印的方式，以增强协议的证明力。
明确协议内容：
- 确保协议内容清晰明确，无歧义，以减少因协议内容不明确而产生的争议。
咨询专业律师：
- 如果您对协议的效力存在疑虑，或者协议内容涉及复杂法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。
总之，按了手印但没有盖章的协议在符合一定条件下是有效的。不过，为了保障您的权益，建议在签订协议时尽量完善相关手续，并咨询专业律师以确保协议的合法性和有效性。