在工程合同无效的情况下，通常只有关于工程价款的约定可以参照适用，其他条款一般不能直接参照。以下是对此问题的详细分析：
一、工程价款约定的参照适用
根据《民法典》第七百九十三条第一款的规定，建设工程施工合同无效，但是建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这一规定明确了在合同无效但工程验收合格的情形下，工程价款的约定可以作为折价补偿的依据。
参照适用的范围：
- 狭义理解：仅指工程价款的计价标准、计价方法等与数额直接相关的约定。
- 广义理解：除了工程价款外，还包括工程款支付时间、支付节点、工程质量等因素。但根据现行法律及司法实践，参照适用的范围主要限于工程价款本身，不包括其他条款。
参照适用的目的：
- 建筑市场中关于工程价款的计算标准较多，计算方法复杂多样。撇开合同关于工程价款的约定，很难确定一个公平公正的折价补偿标准。
- 参照合同关于工程价款的约定来折价补偿承包人，有利于平衡承包人和发包人之间的利益关系，便捷、合理地解决纠纷，也有利于规范建筑市场秩序，保护建筑工人的合法权益。
二、其他条款的参照适用问题
违约条款与争议解决条款：
- 在合同无效的情况下，违约条款和争议解决条款通常不能直接适用。因为合同无效意味着合同自始没有法律约束力，这些条款也就失去了存在的基础。
结算和清理条款：
- 根据《民法典》第五百六十七条的规定，合同的权利义务关系终止不影响合同中结算和清理条款的效力。但这一规定并不适用于合同无效的情形。因为合同无效是自始、当然、确定不发生法律效力，不存在权利义务关系终止的前提。
- 因此，在合同无效的情况下，结算和清理条款（如违约金条款、定金条款、质量保证金条款等）也不能直接参照适用。
三、特殊情形下的参照适用
- 损失赔偿的参照适用：
- 在当事人不能通过举证确定损失数额，并且合同中对损失赔偿标准有明确约定的情况下，根据公平原则，从平衡合同双方当事人的利益角度出发，一方当事人请求参照合同约定的质量标准、建设工期、工程价款支付时间等内容确定损失大小的，人民法院可以结合双方过错程度、过错与损失之间的因果关系等因素作出裁判。但这一参照适用并不意味着这些条款在合同无效后仍然具有完全的法律效力，而是作为确定损失大小的一种参考。
四、法律建议
- 在签订工程合同时，应确保合同内容合法、有效，避免出现导致合同无效的情形。
- 在合同无效的情况下，应及时咨询专业律师，了解可以参照适用的条款范围及相应的法律后果。
- 在处理纠纷时，应依据相关法律和司法解释的规定，结合具体情况进行合理主张和抗辩。
如有任何关于工程合同无效后条款参照适用的具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。