在楼上漏水且已进入诉讼过程，但楼上在诉讼期间偷偷将漏水问题维修好的情况下，您仍然可以申请司法鉴定来明确责任与损失。以下是具体的鉴定步骤和要点：
一、申请司法鉴定
向法院提出申请：
- 您需要向受理此案的法院提出司法鉴定申请，明确说明鉴定的目的和范围，即确定漏水原因及财产损失评估。
法院委托鉴定机构：
- 法院会根据您的申请，委托具有相应资质的司法鉴定机构进行鉴定。这些机构通常具备专业的技术和设备，能够准确地进行现场勘查和检测。
二、鉴定机构的工作流程
现场勘查与检测：
- 鉴定机构会派专业人员到现场进行勘查，查看漏水处周边的建筑结构、材料，并使用专业仪器寻找潜在的渗漏点。
- 尽管漏水问题已被修复，但鉴定人员仍可能通过痕迹分析、材料检测等手段，推断出漏水的原因和位置。
鉴定内容：
- 漏水原因：包括管道破裂、防水层损坏等可能导致漏水的因素。
- 财产损失评估：对因漏水造成的装修损坏、物品损失等进行评估。
出具专业报告：
- 鉴定机构会根据现场勘查和检测的结果，按照标准规范进行科学评估，并出具专业报告。这份报告是确定责任划分和赔偿范围的关键证据。
三、其他注意事项
查看维修记录：
- 在申请鉴定前，您可以要求楼上提供维修记录，包括维修时间、维修内容、维修人员等信息，以确保维修确实针对漏水问题进行了处理。
要求防水测试报告：
- 如果可能的话，您可以要求楼上提供维修后的防水测试报告，以证明维修效果。
密切观察维修后情况：
- 在维修后的一段时间内，您可以密切观察是否还有漏水迹象，以便在鉴定时提供更有力的证据。
准备起诉材料：
- 除了申请司法鉴定外，您还需要准备民事起诉状、双方身份信息、证据材料（如现场照片、鉴定报告等）以及与楼上业主的沟通协商记录等起诉材料。
四、后续行动
- 在收到鉴定报告后，您可以根据报告中的结论与楼上业主进行协商，确定责任划分和赔偿范围。
- 如果协商不成，您可以依据鉴定报告和其他起诉材料，向法院提起诉讼，要求楼上业主承担相应的法律责任。
总之，即使楼上在诉讼过程中偷偷维修好了漏水问题，您仍然可以通过申请司法鉴定来明确责任与损失。在申请鉴定时，请确保提供充分的证据和信息，以便鉴定机构能够准确地进行评估和判断。