针对您提出的“整合失败，投资如何维权”以及“矿山整治过程中企业受损怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、整合失败，投资如何维权？

1. 明确法律依据

首先，我们需要明确的是，尽管《会议纪要》并非正式的行政决定，但它涉及了具体的行政安排和权利义务分配，且由行政机关作出，因此具有行政约束力。根据《最高人民法院关于适用〈行政诉讼法〉的解释》，行政机关通过会议纪要等形式作出的具有行政效力的决定，属于可诉的行政行为。

2. 信赖利益保护

在本案中，当地主管部门通过《会议纪要》指定了整合主体，并明确了出资义务和后续安排。民营企业基于对该行政承诺的信赖，投入了巨资完成整合任务。根据《优化营商环境条例》和《民营经济促进法》的相关规定，民营企业的信赖利益应受法律保护。行政机关不得以行政区划调整、政府换届等为由，不履行、不完全履行或者迟延履行与市场主体签订的有效合同。

3. 维权路径

• 全面收集证据：包括会议纪要、整合协议、付款凭证、资产评估报告、政府承诺文件等，以证明投资的合法性与行政承诺的存在。
• 启动行政协商程序：向当地主管部门提交书面申请，依据相关法规，主张信赖利益保护，要求给予合理补偿。
• 申请行政复议或提起行政诉讼：若协商无果，可针对行政不作为或违约行为提起复议或诉讼，请求确认行政行为违法，并判令其履行补偿职责。
• 探索多元解决机制：可通过信访督办、检察监督、人大监督等途径推动问题解决，以避免诉讼周期长、执行难等问题。

二、矿山整治过程中企业受损怎么办？

1. 评估损失

企业应首先对自身的损失进行全面评估，包括直接投资损失、融资成本、人员费用、预期收益等。这有助于企业在后续维权过程中明确诉求。

2. 寻求政策支持

企业可以积极与当地政府沟通，了解是否有相关的政策支持或补偿机制。在某些情况下，政府可能会出台针对矿山整治过程中受损企业的补偿政策。

3. 法律途径维权

如果政策支持不足或无法满足企业的合理诉求，企业可以考虑通过法律途径维权。这包括提起行政诉讼或民事诉讼，要求政府或相关责任方承担赔偿责任。

4. 加强风险评估与预防

对于未来可能参与的类似项目，企业应加强风险评估与预防工作。在参与项目前，应对项目的可行性、政策风险、市场风险等进行全面评估，并制定相应的风险应对措施。

三、总结与建议

针对整合失败和矿山整治过程中企业受损的问题，企业应积极采取措施维护自身权益。同时，政府也应加强监管和政策支持，避免将政策风险转嫁给民营企业。对于历史遗留问题，政府应主动担当，依法补偿，以重建政商信任。

最后，我建议您在遇到类似问题时，及时咨询专业律师或法律机构，以获取更具体、更专业的法律建议。希望以上解答能对您有所帮助。