在交通事故中，当您作为雇主责任险的投保方且承担次要责任时，通常是可以进行代位赔偿的。以下是对这一问题的详细解答：
一、代位赔偿的基本概念
代位赔偿，即当保险所涉及的物品（如车辆）遭遇保险事故而导致损失，且按照法律规定应当由第三方来承担赔偿责任时，保险公司从支付保险赔偿金的那一天起，在赔偿金额的范围之内，相应地获得了向第三方请求赔偿的权利。在您承担次要责任的情况下，如果您的保险公司已经对您进行了赔偿，那么它就有权向对方（即主要责任方）进行代位追偿。
二、代位赔偿的条件与限制
事故责任明确：首先，交通事故的责任必须明确，且您被认定为次要责任方。这通常需要交警出具的事故责任认定书作为依据。
对方车辆有保险：对方车辆应购买有相应的保险，以便在代位追偿时，您的保险公司能够向对方的保险公司进行索赔。
己方已尽力求偿：在申请代位赔偿前，您应已向对方主张过赔偿，但对方未给予足额赔偿、拒绝赔偿或无力赔偿。
提供必要文件：您需要向保险公司提供事故的相关证据，如现场照片、交警认定书等，以及签署权益转让书，将向责任方追偿的权利转让给保险公司。
三、代位赔偿的流程
及时报案：在发生交通事故后，您应及时向自己的保险公司报案，并配合其进行调查理赔工作。
准备材料：根据保险公司的要求，准备并提交事故的相关证据和材料。
申请代位赔偿：在满足上述条件后，您可以向自己的保险公司申请代位赔偿。
保险公司追偿：保险公司审核通过后，会先行对您进行赔付，并随后向对方（或对方的保险公司）进行代位追偿。
四、注意事项
保费可能受影响：代位追偿后，您的保险保费可能会受到影响，具体的调整幅度因保险公司和实际情况而异。
配合保险公司：在向对方追讨赔偿过程中，您需要配合保险公司提供相应证据材料，并积极参与调解或诉讼等程序。
了解地区差异：不同地区对于代位赔偿的执行标准可能存在差异，建议您在申请前咨询当地保险公司或相关部门以获取准确信息。
综上所述，当您在交通事故中承担次要责任时，通常是可以进行代位赔偿的。但请注意满足相关条件并遵循保险公司的规定流程进行操作。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请及时与保险公司沟通。