两轮电动车肇事逃逸自首后是否会有案底，主要取决于事故的性质、后果以及肇事者的行为是否构成刑事犯罪。以下是对这一问题的详细分析：

1. 不构成犯罪的情况：

   • 情况描述：如果两轮电动车肇事造成的后果较轻，未达到交通肇事罪或其他刑事犯罪的定罪标准，那么肇事者将不会受到刑事处罚。
   • 法律责任：在此情况下，肇事者仍需承担民事责任，如赔偿受害者的医疗费用、财产损失等。同时，根据《道路交通安全法》的相关规定，肇事者也可能面临行政处罚，如罚款、行政拘留等。但这些处罚通常不会留下案底。
   • 实际影响：虽然不构成犯罪，但肇事者的行为仍会被记录在案，作为未来可能涉及的民事或行政纠纷的参考依据。然而，这种记录并不等同于刑事案底，对肇事者的日常生活和工作影响相对较小。

2. 构成犯罪的情况：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，将受到刑事处罚。其中，交通肇事后逃逸是加重处罚的情节之一。
   • 情况描述：如果两轮电动车肇事造成的后果严重，达到交通肇事罪的定罪标准，且肇事者逃逸，那么将被追究刑事责任。
   • 刑事责任：在此情况下，肇事者可能会面临有期徒刑、拘役等刑罚，并因此留下刑事案底。即使事后自首，其行为的违法性质已确定，案底仍然会留下。
   • 实际影响：刑事案底将对肇事者的未来生活和工作产生较大影响，如在求职、申请某些许可证或进行背景调查时，案底可能成为不利因素。

建议与注意事项：

• 及时自首：虽然自首不能消除案底（如果构成犯罪的话），但它是减轻刑事责任的一个重要因素。自首表明肇事者有悔过之意，愿意承担法律责任，这有助于在量刑时得到从轻处理。
• 遵守交通规则：为了避免不必要的法律后果，驾驶者在驾驶两轮电动车时应严格遵守交通规则，确保行车安全。
• 积极承担责任：在发生交通事故后，驾驶者应立即停车、保护现场、抢救受伤人员，并主动向公安机关交通管理部门报案。这样不仅可以减轻自身的法律责任，也是对他人生命的尊重和法律尊严的维护。

总结：两轮电动车肇事逃逸自首后是否会有案底，取决于事故的具体情况和肇事者的行为性质。如果事故后果较轻，未构成犯罪，则通常不会留下案底；但如果事故后果严重，构成犯罪，则即使自首也会留下案底。因此，驾驶者在驾驶过程中应严格遵守交通规则，确保行车安全，并在发生事故后积极承担责任。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。