结论：公司与公司之间的租车协议是否需要营运证，取决于车辆的使用性质和租赁目的。若车辆仅用于企业内部职工上下班接送且不参与其他营运活动，则通常不需要营运证；但若车辆用于商业营运活动，则必须办理营运证。

分析：

1. 非营运用途：

   • 情况说明：如果公司租用的车辆仅用于企业内部职工的上下班接送，且不参与其他任何形式的营运活动（如对外提供运输服务），那么根据相关规定，这种车辆通常不需要办理道路运输证（即营运证）。
   • 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确提及此类情况，但根据道路运输管理的原则和精神，非营运车辆不应被要求办理营运证。此外，从实际案例来看，如您提供的参考问题中，政府部门也明确表示了类似情况下的车辆不需要申请车辆道路运输证。

2. 营运用途：

   • 情况说明：如果公司租用的车辆用于商业营运活动，如对外提供运输服务、旅游包车等，那么根据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规的规定，这种车辆必须办理道路运输证（即营运证），否则将构成非法营运。
   • 法律后果：未办理营运证而从事营运活动的，将面临交通主管部门的处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得等。同时，如果发生交通事故，保险公司也可能因车辆未办理营运证而拒绝赔偿。

3. 租赁企业的资质要求：

   • 情况说明：无论车辆是否用于营运活动，租赁企业都应具备相应的资质。对于非营运车辆，租赁企业应确保车辆符合安全标准、具备合法的行驶证等；对于营运车辆，租赁企业还应具备相应的客运资质，如道路运输经营许可证等。
   • 建议：在与租赁企业签订租车协议时，公司应仔细审查租赁企业的资质和车辆的相关证件，确保租赁活动的合法性和安全性。

建议与总结：

• 在签订租车协议前，公司应明确车辆的使用性质和租赁目的，以便确定是否需要办理营运证。
• 如果车辆仅用于企业内部职工上下班接送且不参与其他营运活动，可以与租赁企业协商在协议中明确这一点，并确保车辆符合相关安全标准。
• 如果车辆用于商业营运活动，公司必须确保租赁企业具备相应的客运资质，并督促其办理营运证。
• 在任何情况下，公司都应仔细审查租赁企业的资质和车辆的相关证件，以降低法律风险。

如有其他公司法务方面的疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。