工厂安排加班12小时且两班倒的做法，在多数情况下是违法的。以下从不同角度为您详细分析：

一、从工作时间角度分析

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果工厂安排劳动者每日工作12小时，显然超出了法定工作时间。即使考虑加班的情况，根据《劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。因此，每日加班4小时（即工作12小时）已经超出了法律规定的加班时限。

二、从休息休假角度分析

劳动者依法享有休息休假的权利。工厂安排两班倒，意味着劳动者可能连续工作多日而没有足够的休息时间。这不仅违反了《劳动法》中关于工作时间的规定，也可能侵犯了劳动者的休息休假权。长期如此，还可能对劳动者的身体健康造成严重影响。

三、从法律责任角度分析

如果工厂违反了《劳动法》中关于工作时间和休息休假的规定，劳动者有权向劳动监察部门投诉，要求工厂改正违法行为，并可能获得相应的赔偿。同时，工厂也可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。

四、特殊情况下的合法性探讨

虽然一般情况下工厂安排加班12小时且两班倒是违法的，但也存在一些特殊情况。例如，在发生自然灾害、事故或者因其他原因，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理的情况下，延长工作时间可能不受上述时限的限制。但这种情况非常特殊且罕见，且必须严格符合法律规定的条件。

五、建议与措施

1. 与工厂协商：如果您认为工厂的工作时间安排不合理，可以首先与工厂进行协商，寻求合理的解决方案。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，要求其对工厂的违法行为进行调查和处理。
3. 寻求法律援助：在必要时，您可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

如果您遇到类似问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。