营业执照未注销且股东被抓，公司应依法处理注销事宜，并确保股东权益得到妥善处理。针对这一情况，以下是我的详细分析：
一. 处理营业执照未注销的问题
明确法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》第一百八十条，公司解散的原因包括依法被吊销营业执照、责令关闭或者被撤销等情形。同时，公司应依法进行清算并注销。
成立清算组：
- 公司应依法成立清算组，由股东或董事组成，负责处理公司清算事务，包括清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知和公告债权人、处理未了结的业务、清缴税款、清理债权债务等。
进行清算和注销登记：
- 清算组成立后，应按照法律规定进行清算工作，制作清算报告，并报请股东会、股东大会或人民法院确认。随后，公司应向登记机关提交清算报告和其他相关文件，申请注销公司登记。
二. 处理股东被抓的问题
与被抓股东协商或通知：
- 尽管股东被抓，公司仍应尽力与其取得联系，并就其权益进行协商。如果可能，应获得其对公司注销的书面同意。若无法直接联系，可通过其法定代理人或律师进行沟通。
寻求法律途径解决：
- 如果被抓股东不同意注销或无法联系到其本人，公司可依据公司章程或相关法律规定，通过法律途径（如诉讼）解决股东之间的分歧。在此过程中，应确保公司行为合法合规，避免侵犯任何股东的合法权益。
三. 注意事项
保护债权人利益：
- 在公司注销过程中，应确保债权人的利益得到充分保护。依据《中华人民共和国公司法》第三条，公司以其全部财产对公司的债务承担责任。因此，在注销前必须清偿所有债务或作出妥善安排。
遵守相关法律法规：
- 在整个注销过程中，公司必须严格遵守《中华人民共和国公司法》等相关法律法规的规定，确保所有操作合法合规。
四. 我的建议
- 及时采取行动：公司应尽快成立清算组，启动清算程序，并着手办理注销登记手续，以避免因营业执照未注销而引发的法律风险。
- 妥善处理股东权益：对于被抓股东，公司应依法处理其权益问题，确保所有股东在注销过程中得到公平对待。
- 咨询专业律师：鉴于公司注销涉及复杂的法律程序和股东权益问题，我建议公司在整个过程中咨询专业律师，以确保所有操作合法合规并有效保护公司和股东的权益。
如有进一步需要，您可以继续咨询我。