销售非法卷烟的，违法所得将被没收，并将处以违法销售总额20%以上50%以下的罚款。具体分析如下：

一. 销售非法卷烟的处罚

1. 法律依据：根据《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》第二十五条，任何单位或者个人不得销售非法生产的烟草制品。对于违反此规定的行为，该条例第五十八条进一步规定，由烟草专卖行政主管部门责令停止销售，没收违法所得，并处以违法销售总额20%以上50%以下的罚款，同时将非法销售的烟草专卖品公开销毁。

二. 违法所得的处理

1. 没收违法所得：一旦查实存在销售非法卷烟的行为，烟草专卖行政主管部门将没收违法所得，即销售非法卷烟所获得的全部收入。

三. 罚款的计算

1. 罚款范围：罚款的数额将根据违法销售总额来确定，具体为违法销售总额的20%至50%。这一比例范围旨在根据违法行为的严重程度和具体情况进行灵活调整。
2. 计算示例：假设某销售者非法销售卷烟的总额为10万元，那么其可能面临的罚款将在2万元（10万元的20%）至5万元（10万元的50%）之间。

综上所述，销售非法卷烟的，不仅违法所得将被没收，还将面临一定比例的罚款。这一处罚措施旨在打击非法卷烟销售行为，保护消费者的合法权益，维护市场秩序。我建议所有烟草销售者严格遵守相关法律法规，确保销售的烟草制品合法合规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。