合作医疗被车子撞了且对方全责的情况下，住院费用是可以报销的，但具体报销方式和比例需根据实际情况和当地政策来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、合作医疗的报销性质
合作医疗，通常指的是新型农村合作医疗制度（简称“新农合”），是我国农村地区的一项基本医疗保障制度。它旨在为农民提供基本的医疗保障，减轻因疾病带来的经济负担。在合作医疗的保障范围内，参保人员因疾病住院所产生的医疗费用，可以按照一定比例进行报销。
二、交通事故中的医疗费用报销
对方全责的情况：
- 当交通事故由对方承担全部责任时，受害方的医疗费用原则上应由责任方（即对方）承担。这包括住院费、手术费、药费等直接医疗费用。
- 然而，在实际操作中，如果受害方已经通过合作医疗报销了部分医疗费用，那么这部分费用在后续向责任方索赔时，可能需要从总赔偿金额中扣除。这是因为合作医疗的报销实际上是一种“先行垫付”，最终的责任仍应由责任方承担。
合作医疗与交通事故赔偿的衔接：
- 受害方可以先通过合作医疗报销部分医疗费用，以减轻经济压力。
- 随后，在向责任方索赔时，应提供完整的医疗费用发票和报销凭证，以便责任方了解实际发生的医疗费用情况。
- 如果合作医疗已经报销了部分费用，那么在索赔时，这部分费用可能不再重复计算。
三、具体操作建议
及时报案并保留证据：
- 发生交通事故后，应立即报警并保留好相关证据，如事故现场照片、交警出具的事故责任认定书等。
- 同时，及时联系合作医疗管理部门，了解报销流程和所需材料。
合理选择报销方式：
- 根据实际情况和当地政策，选择合适的报销方式。如果合作医疗报销比例较高且流程简便，可以先通过合作医疗报销部分费用。
- 如果责任方愿意承担全部医疗费用且报销流程更为简便，也可以考虑直接由责任方承担。
咨询专业律师：
- 在处理交通事故赔偿问题时，如果涉及金额较大或情况复杂，建议咨询专业律师以获取更准确的法律建议和帮助。不过，作为齐凤律师，我可以直接为你提供这方面的法律咨询。
四、注意事项
- 不同地区的合作医疗政策和报销比例可能有所不同，因此在实际操作中需根据当地政策来确定。
- 在向责任方索赔时，应确保提供的医疗费用发票和报销凭证真实有效，以避免因证据不足而导致索赔失败。
总结来说，合作医疗被车子撞了且对方全责的情况下，住院费用是可以报销的。但具体报销方式和比例需根据实际情况和当地政策来确定。在处理此类问题时，建议及时报案、保留证据，并合理选择报销方式。如有需要，可以直接向我咨询以获取更准确的法律建议和帮助。