撰写父亲将房屋过继（这里理解为赠与）给儿子的协议时，需要确保协议内容完整、合法且有效，以保护双方的权益。以下是一份详细的协议编写指南及示例：

一、协议核心要素

1. 标题：明确协议性质，如《房屋赠与协议》。

2. 当事人信息：

   • 赠与人（父亲）：姓名、身份证号、联系方式、住址。
   • 受赠人（儿子）：姓名、身份证号、联系方式、住址，并注明父子关系。

3. 赠与标的：

   • 房屋的具体坐落位置（精确到门牌号）。
   • 房屋的面积、产权证号。
   • 如有附属设施（如车位、装修等），也应详细说明。

4. 赠与意愿与条件：

   • 明确赠与人自愿将房屋无偿赠与受赠人。
   • 说明赠与是否附带条件（如赡养义务等），若无条件则写明“无附加义务”。

5. 权利义务条款：

   • 赠与人应保证房屋权属清晰，无抵押、查封等权利瑕疵。
   • 受赠人应配合办理过户手续，并承担相应费用（或按约定分担）。

6. 违约责任：

   • 约定若一方违反协议应承担的责任，如赔偿损失、支付违约金等。

7. 争议解决：

   • 约定若发生争议，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可提交仲裁机构仲裁或向人民法院提起诉讼。

8. 签署与生效：

   • 协议应由双方签字（或捺印）并注明签订日期。
   • 建议对协议进行公证，以增强其法律效力。

二、协议示例

房屋赠与协议

甲方（赠与人）：[父亲姓名]，身份证号：[父亲身份证号]，住址：[父亲住址]

乙方（受赠人）：[儿子姓名]，身份证号：[儿子身份证号]，住址：[儿子住址]（父子关系）

鉴于甲方自愿将其名下房产赠与乙方，经双方友好协商，达成如下协议：

第一条 赠与标的

甲方自愿将其名下位于[房屋地址]的房产（房产证号：[房产证号]，建筑面积[面积]㎡）无偿赠与乙方，附属设施包括[如有附属设施，详细说明]。

第二条 赠与性质

本赠与为无条件赠与，甲方不得单方撤销（经公证后适用此条款）。

第三条 双方承诺

1. 甲方保证房屋权属清晰，无任何权利瑕疵；
2. 乙方需在合同签订后[合理时间，如30日]内配合办理过户登记。

第四条 费用承担

过户税费由[约定承担方，如乙方]承担；其他费用（如评估费）由[约定承担方，如双方协商分担]承担。

第五条 违约责任

若甲方违约，需赔偿乙方房屋市场价值[约定比例，如20%]的违约金；若乙方拖延过户超[约定时间，如60日]，甲方有权解除合同。

第六条 争议解决

因本合同产生的纠纷，双方应首先通过协商解决；协商不成的，提交[约定仲裁机构或法院名称]仲裁/诉讼解决。

第七条 合同生效

本合同自双方签字并经公证处公证之日起生效。一式三份，甲乙双方各执一份，公证处留存一份。

甲方（签字捺印）：[父亲姓名] 日期：[签订日期]

乙方（签字捺印）：[儿子姓名] 日期：[签订日期]

公证处意见：[公证处盖章及公证员签字]

三、注意事项

1. 公证必要性：根据相关法律规定，未公证的赠与合同在过户前可能被撤销。公证后，赠与合同的法律效力将得到增强。

2. 税务合规：直系亲属间的房产赠与通常免征个人所得税，但需缴纳契税等税费。建议提前咨询当地税务部门以了解具体税费标准。

3. 产权过户：协议生效后，双方应及时办理不动产变更登记手续，以确保房屋产权的顺利转移。

4. 特殊情形处理：若房屋存在贷款或其他债务，需先清偿债务或取得债权人同意后再进行赠与；若涉及多子女家庭，建议书面告知其他继承人以避免后续纠纷。

通过遵循上述指南和示例，您可以撰写一份合法、有效且完整的房屋赠与协议。在正式签订前，建议由专业律师对协议进行审核以确保其合法性和有效性。