针对您提出的“农业农村局对违法占用集体建设用地建住宅的立案查处程序”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据
首先，我们需要明确的是，根据2020年1月1日起实施的新修订的《土地管理法》第七十八条规定，农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由农业农村主管部门负责查处。这一条款明确了农业农村主管部门在农村村民非法占地建住宅行为上的查处职责。
二、立案查处程序
发现与受理：
- 农业农村局在日常巡查、群众举报或其他渠道发现农村村民存在违法占用集体建设用地建住宅的行为后，应进行初步调查核实。
- 核实情况后，若确认存在违法行为，农业农村局应正式受理该案件，并启动立案程序。
立案与调查：
- 农业农村局应制作立案文书，明确案件来源、违法事实、立案依据等信息，并报请相关负责人批准立案。
- 立案后，农业农村局应组织执法人员对案件进行深入调查，收集相关证据，包括现场勘查记录、询问笔录、照片、视频等。
- 调查过程中，执法人员应依法出示执法证件，表明身份，并告知当事人有关权利义务。
审查与决定：
- 调查结束后，农业农村局应对收集到的证据进行审查，分析违法事实是否清楚、证据是否确凿充分。
- 若确认违法事实成立，农业农村局应依法作出行政处罚决定，明确处罚种类、幅度、依据等信息，并告知当事人享有陈述、申辩、要求听证等权利。
送达与执行：
- 行政处罚决定作出后，农业农村局应依法将决定书送达当事人，并告知其履行方式和期限。
- 若当事人逾期不履行行政处罚决定，农业农村局可依法申请人民法院强制执行。
三、注意事项
依法行政：
- 农业农村局在查处过程中应严格遵守法律法规，确保程序合法、证据确凿、处罚适当。
- 不得超越职权范围或滥用职权进行查处。
保护当事人权益：
- 在查处过程中，农业农村局应充分保障当事人的合法权益，如陈述权、申辩权、要求听证权等。
- 对当事人的合理诉求应予以充分考虑和回应。
加强宣传教育：
- 农业农村局在查处过程中应加强宣传教育力度，提高农村村民的法律意识和守法自觉性。
- 通过典型案例剖析、法律知识普及等方式，引导农村村民依法依规使用土地。
综上所述，农业农村局对违法占用集体建设用地建住宅的立案查处程序包括发现与受理、立案与调查、审查与决定、送达与执行等环节。在查处过程中，农业农村局应严格遵守法律法规，保护当事人权益，并加强宣传教育力度。