结论前置：

1. 替考未遂若未构成犯罪，则不存在刑事追诉时效的问题；
2. 若替考未遂行为构成犯罪，但已过追诉时效期限，则不再追诉；
3. 若替考未遂行为构成犯罪且未过追诉时效期限，但已被纪委给予党内警告并结案，这并不影响刑事追诉的进行。

详细分析：

首先，我们需要明确的是，刑事追诉时效是针对犯罪行为而言的。如果替考未遂的行为并未构成犯罪，那么自然就不存在刑事追诉时效的问题。在这种情况下，纪委给予的党内警告是一种行政处分或党纪处分，与刑事追诉无关。

其次，如果替考未遂的行为构成了犯罪（例如，根据《刑法》的相关规定，组织考试作弊罪等），那么就需要考虑刑事追诉时效的问题。根据《刑法》第八十七条的规定，犯罪经过下列期限不再追诉：

• 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；
• 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；
• 法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；
• 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。

如果替考未遂的行为所构成的犯罪已经过了上述的追诉时效期限，那么就不再追诉。

然而，如果替考未遂的行为所构成的犯罪并未过追诉时效期限，但已经被纪委给予党内警告并结案，这并不意味着刑事追诉就不会再进行。因为党内警告和结案是党纪处分和行政程序的结果，而刑事追诉是司法程序的一部分，两者是独立的。党纪处分和行政程序并不能替代或阻止司法程序的进行。

特殊情况与建议：

在实际操作中，如果纪委已经对替考未遂的行为进行了处理并结案，这可能会在一定程度上影响司法机关对案件的进一步处理。例如，司法机关可能会考虑纪委的处理结果作为量刑的参考因素之一。但是，这并不意味着司法机关会因此放弃对犯罪行为的追诉。

总结与建议：

1. 如果替考未遂的行为并未构成犯罪，那么就不存在刑事追诉时效的问题。
2. 如果构成了犯罪，但已经过了追诉时效期限，那么就不再追诉。
3. 如果构成了犯罪且未过追诉时效期限，即使已经被纪委给予党内警告并结案，司法机关仍可能进行刑事追诉。

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