针对“肇事司机有病法院怎么判”这一问题，我们需要结合具体情况来进行分析，以下是几种可能的情况及相应的法律判断：

1. 司机明知有病仍违法上路并肇事

   • 法律判断：若司机明知自己患有可能影响驾驶安全的疾病，如癫痫、心脏病等，在未采取有效控制措施或未告知相关部门的情况下，仍然坚持驾驶机动车上路，并因此导致交通事故的发生，且造成一人以上重伤或重大财产损失，负事故全部或主要责任，那么该司机可能构成交通肇事罪。
   • 量刑标准：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，构成交通肇事罪的，处三年以下有期徒刑或者拘役；交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。

2. 司机事先不知有病，驾车时突发疾病肇事

   • 法律判断：若司机事先并不知道自己患有影响驾驶安全的疾病，在驾车过程中突发疾病，导致失去对车辆的控制而发生交通事故，这种情况可能被认定为意外事件。根据《中华人民共和国刑法》第十六条，行为在客观上虽然造成了损害结果，但是不是出于故意或者过失，而是由于不能抗拒或者不能预见的原因所引起的，不是犯罪。
   • 民事责任：尽管不构成犯罪，但司机或其家属可能仍需根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，对受害者的人身伤害和财产损失承担一定的民事赔偿责任。

3. 司机有病但已采取合理措施仍肇事

   • 法律判断：如果司机虽然患有影响驾驶安全的疾病，但已经采取了合理的控制措施，如按时服药、定期检查等，并在驾驶过程中尽到了合理的注意义务，但仍然因为疾病突发或其他不可抗力因素导致交通事故的发生，这种情况下，司机的责任可能会相对减轻。
   • 责任划分：法院在判决时，会综合考虑司机的过错程度、疾病的严重性、是否采取了合理措施以及事故的具体情况等因素，来划分责任比例。

法律建议：

• 对于患有影响驾驶安全疾病的司机，建议在治疗期间或疾病未得到有效控制前，避免驾驶机动车，以确保自己和他人的安全。
• 如果不幸发生交通事故，应立即报警并保护好现场，同时积极救助伤者，配合相关部门的调查和处理工作。
• 在处理交通事故赔偿问题时，建议咨询专业律师，以了解自己的权利和义务，避免因不了解法律而造成不必要的损失。

可能后果：

• 如果构成交通肇事罪，司机将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役等，同时还需要承担民事赔偿责任。
• 如果不构成犯罪，但需要承担民事赔偿责任，司机或其家属应根据法院的判决，对受害者进行相应的赔偿。

综上所述，肇事司机有病时法院的判决会结合具体情况进行综合分析，包括司机的过错程度、疾病的严重性、是否采取了合理措施以及事故的具体情况等因素。因此，在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律判断和建议。