结论前置：针对村民侵占集体土地的情况，支部书记和纪委应依法依规进行调查处理，具体处理方式需根据侵占行为的性质、情节及后果来决定。

核心前提：此问题涉及农村集体土地管理、村民自治以及党的纪律处分等多个方面，需要综合考虑法律、政策以及党内规定。

具体处理方式：

1. 调查核实：

   • 支部书记应首先组织相关人员对侵占行为进行调查核实，收集证据，包括侵占土地的时间、地点、面积、用途等。
   • 纪委应参与调查过程，确保调查的公正性和客观性，同时对支部书记的调查工作进行监督。

2. 依法处理：

   • 根据调查结果，如果侵占行为构成违法，如违反《土地管理法》等相关法律法规，应依法向土地管理部门报告，由土地管理部门进行行政处罚，如责令退还土地、罚款等。
   • 如果侵占行为涉及刑事犯罪，如非法占用农用地罪，应依法向公安机关报案，由公安机关进行刑事立案侦查。

3. 党内处分：

   • 如果侵占土地的村民是党员，且其行为违反了党的纪律，如违反廉洁纪律、群众纪律等，纪委应根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，对其进行党内处分，如警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等。
   • 纪委在处理过程中，应确保程序的合法性和正当性，保障被处分党员的申诉权利。

4. 恢复土地原状：

   • 无论侵占行为是否构成违法或犯罪，都应要求侵占者恢复土地原状，确保集体土地的完整性和使用权不受侵害。

5. 加强宣传教育：

   • 支部书记和纪委应加强对村民的法律宣传和教育，提高村民的法律意识和纪律观念，预防类似侵占行为的发生。

额外建议：在处理过程中，支部书记和纪委应保持密切沟通，确保处理工作的顺利进行。同时，应注重保护村民的合法权益，避免因处理不当而引发新的矛盾和问题。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询。