一般情况下，你公司起诉对方公司，你公司的账户不会被冻结。下面我详细解释一下：

在公司之间的诉讼中，通常不会因为一方提起诉讼而导致其账户被冻结。账户冻结通常是在特定情况下，如涉及债务执行、防止资产转移等，由法院根据债权人的申请或案件的具体情况作出的保全措施。

1. 诉讼与账户冻结的关系：诉讼本身是为了解决争议而进行的法律程序，它并不直接导致任何一方的账户被冻结。只有在诉讼过程中，如果一方申请财产保全，并且法院认为有必要采取保全措施以防止资产流失或确保判决的执行，才可能会裁定冻结相关账户。

2. 财产保全的条件：财产保全通常需要在满足一定条件下才能申请，比如有明确的债权债务关系、存在紧急情况等。而且，即使申请了财产保全，法院也会根据案件的具体情况和证据来决定是否采取冻结措施。

3. 对你公司的建议：如果你公司担心账户被冻结的风险，可以在提起诉讼前咨询专业律师（比如我），评估案件情况和可能的风险。同时，确保公司的财务状况和资产状况良好，以便在必要时提供足够的担保或证明来避免不必要的保全措施。

总之，你公司起诉对方公司并不会直接导致你公司的账户被冻结。但如果涉及财产保全等特殊情况，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。