工程双方违约金的约定主要遵循以下原则和要点：

1. 自由约定原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，工程合同双方当事人可以自由约定违约金的支付金额或损失赔偿额的计算方法。这一原则赋予了合同双方较大的自主权，可以根据工程实际情况和双方需求，灵活设定违约金条款。

2. 具体约定方式：

   • 具体数额：双方可以直接约定违约金的具体金额，例如“每逾期一天支付5000元违约金”。这种约定方式简单明了，便于执行和计算。
   • 损失赔偿额计算方法：除了具体数额，双方还可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法，如“按照未付金额的每日万分之五支付逾期付款违约金”。这种方法更加灵活，能够根据实际损失情况调整违约金数额，更合理地反映违约造成的损失。

3. 法律限制与调整：

   • 违约金数额调整：若约定的违约金低于实际造成的损失，人民法院或仲裁机构可根据当事人的请求予以增加；若约定的违约金过分高于造成的损失（通常指超过损失的30%），则可适当减少。这一规定旨在平衡双方利益，防止违约金过高或过低导致的不公平现象。
   • 明确损失范围：在主张调整违约金时，主张方需承担举证责任，证明实际损失的范围。这包括直接损失（如额外支出费用）和间接损失（如可得利益损失）。间接损失的举证相对困难，需有充分证据证明其确定性和可预见性。

4. 其他关键注意事项：

   • 明确违约情形：工程合同中应详细列举各种可能的违约情形，并针对不同的违约情形设定相应的违约金标准。例如，针对承包方的工程质量违约、工期违约以及发包方的付款违约等分别设置条款，以确保违约责任的清晰明确。
   • 遵循公平原则：在约定违约金时，应充分考虑合同的履行难度、双方的承受能力等因素，避免约定过高或过低的违约金。过高的违约金可能导致显失公平，引发不必要的纠纷；过低的违约金则可能无法有效约束违约行为，损害守约方的利益。
   • 继续履行合同或赔偿损失：值得注意的是，支付违约金并不免除违约方继续履行合同或赔偿损失的责任。除非合同另有约定或法律另有规定，否则违约方在支付违约金后仍需按合同约定履行义务或赔偿因此给对方造成的损失。

法律建议：

• 在签订工程合同时，双方应仔细审查违约金条款，确保其明确、合理且符合法律法规的要求。
• 若对违约金条款有疑问或需要调整，应及时与对方协商并达成一致意见。
• 在发生违约纠纷时，应及时寻求专业法律意见，以维护自身合法权益。

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