针对您朋友通过扫描公司账户二维码借款后未归还的情况，您可以采取以下法律措施来维护自身权益：
明确借款事实与证据收集
- 借款事实确认：首先，您需要确认借款的具体事实，包括借款金额、借款时间、借款方式（通过扫描公司账户二维码）以及是否有明确的还款期限约定。
- 证据收集：收集并保存所有与借款相关的证据，如转账记录、聊天记录、借款协议（如有）等。这些证据将作为您主张权利的重要依据。特别是转账记录，应显示资金从您的账户转入公司账户，并注明借款用途或备注信息。
沟通协商
- 在采取法律行动之前，您可以尝试与朋友进行沟通协商，明确表达您的还款要求，并给予其合理的还款期限。沟通过程中，建议保留好沟通记录，如短信、微信聊天记录等，以备不时之需。
法律途径追讨
- 起诉准备：如果沟通无果，您可以准备向法院提起诉讼。起诉时，需要明确被告的身份信息（包括公司名称、统一社会信用代码等），并提交起诉状及相关证据材料。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第六百七十五条，借款人应当按照约定的期限返还借款。对借款期限没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定的，借款人可以随时返还；贷款人可以催告借款人在合理期限内返还。同时，根据第六百七十六条，如果借款人未按约定的期限返还借款，您还可以要求其支付逾期利息。
- 诉讼流程：向法院提起诉讼后，法院将依法进行审理，并根据借款合同及相关证据作出判决。如果判决支持您的诉求，但朋友仍拒不履行还款义务，您可以申请法院强制执行，包括冻结、划拨其银行存款，拍卖其名下财产等。
注意诉讼时效
- 诉讼时效一般为三年，从约定还款期限届满之日起计算。如果超过诉讼时效，您可能会面临权利无法得到完全保护的风险。因此，建议您在发现朋友未按时还款后，及时采取行动，避免超过诉讼时效。
考虑公司账户的特殊性
- 由于借款是转入公司账户，您还需要考虑公司作为借款人的法律地位。如果公司是独立法人，那么您需要以公司为被告提起诉讼。如果朋友是公司的法定代表人或实际控制人，且借款行为与其个人行为混同，您可能还需要考虑追究其个人责任。
建议您采取的行动步骤：
- 首先，与朋友进行沟通协商，明确还款要求并给予合理期限。
- 其次，收集并保存所有与借款相关的证据材料。
- 最后，如果沟通无果且证据充分，及时向法院提起诉讼以维护自身权益。
在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，依法行事。如果您在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。