针对小货车加装车厢后发生交通事故，且被认定为次要责任并导致轻微伤的情况，处罚及责任承担方式如下：
一、责任划分与赔偿原则
责任划分：
- 在交通事故中，责任划分通常依据事故各方的过错程度进行。若小货车因加装车厢等违规行为被认定为次要责任，则意味着在事故中，小货车方的过错程度相对较小，但仍需承担一定比例的赔偿责任。
赔偿原则：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条及《中华人民共和国民法典》的相关规定，机动车发生交通事故造成损害的，先由承保机动车强制保险的保险人在强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足部分，由承保机动车商业保险的保险人按照保险合同的约定予以赔偿；仍然不足或者没有投保机动车商业保险的，由侵权人赔偿。
- 在机动车之间发生交通事故的情况下，次要责任方通常需要承担30%的赔偿责任。这意味着，如果事故造成的损失总额为一定数额，次要责任方需要承担该总额30%的赔偿。
二、具体处罚与赔偿计算
处罚：
- 对于小货车加装车厢的违规行为，交通管理部门可能会根据相关规定对车主或驾驶人进行罚款、扣分等处罚。具体处罚措施需依据地方性法规及交通管理部门的实际执行情况而定。
赔偿计算：
- 假设事故造成的损失总额为X元（包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入等），则次要责任方需要承担的赔偿金额为：X * 30%。
- 例如，若事故造成的损失总额为10000元，则次要责任方需要承担的赔偿金额为3000元。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 若小货车方未按照责任划分承担相应的赔偿责任，可能会面临被强制执行、列入失信被执行人名单等法律后果。
- 同时，加装车厢的违规行为还可能影响车辆的年检、保险理赔等事项。
建议：
- 小货车方应积极配合交通管理部门的调查和处理工作，如实陈述事故经过和违规行为。
- 在承担赔偿责任时，应与对方协商确定赔偿金额和支付方式，并保留好相关证据以备后续需要。
- 若对责任划分或赔偿金额有异议，可以依法申请复核或提起诉讼以维护自身合法权益。
四、特别提醒
- 加装车厢等违规行为不仅可能增加交通事故的风险，还可能面临法律处罚和赔偿责任。因此，建议车主或驾驶人严格遵守交通法规和相关规定，确保车辆的安全性和合规性。
- 在处理交通事故时，建议咨询专业律师以获取更详细和准确的法律意见。若您有任何关于交通运输事故责任的法律问题，可以直接向我咨询。