学校书记担任法人代表并不违法。下面我从几个角度来解释这个问题：

1. 法人代表的资格要求：

   • 根据相关法律法规，法人代表需要具有完全民事行为能力，并且没有法律、行政法规规定的禁止担任法人代表的情形。学校书记作为学校的负责人，通常具备完全民事行为能力，并且没有法律禁止其担任法人代表的情况。

2. 学校法人的特殊性：

   • 学校作为事业单位法人，其法人代表的选任通常遵循特定的程序和规定。这些规定可能因地区、学校类型等因素而有所不同，但一般都会明确法人代表的资格条件和选任程序。学校书记作为学校的高级管理人员，有可能按照法定程序被选为法人代表。

3. 实际操作的合法性：

   • 在实际操作中，学校书记担任法人代表是常见的情况。只要符合相关法律法规和学校章程的规定，学校书记就可以担任法人代表，并代表学校行使法人权利、履行法人义务。

综上所述，学校书记担任法人代表并不违法，但前提是必须符合相关法律法规和学校章程的规定，并按照法定程序进行选任。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。