犯人刑满释放后，被扣押的手机是否会归还，需根据手机与案件的关联性来判断。以下是对此问题的详细分析：
手机与案件无关的情况：
- 根据法律规定，经查与案件无关的被查封、扣押、冻结的财产，应在三天内解除查封、扣押、冻结，并予以退还。因此，如果手机被证实与案件无关，且不属于违禁物品，那么在犯人刑满释放时，相关部门应当归还手机。
- 举例来说，若犯人因盗窃被羁押，但其手机并未用于实施盗窃行为，也未存储与盗窃相关的证据，那么该手机应被视为与案件无关，刑满释放时应予归还。
手机与案件有关的情况：
- 如果手机被用作犯罪工具，或者存储了与案件相关的证据，那么其归还将受到案件处理进程的影响。在案件结束前，手机可能会被继续扣押作为证据。
- 具体来说，若手机被用于实施犯罪行为，如通过手机进行诈骗、传播违法信息等，那么该手机可能被视为涉案物品，依法予以没收，不会归还给犯人。
- 另外，如果手机中存储了与案件相关的证据，如通话记录、短信、聊天记录等，那么在案件处理完毕前，手机可能会被继续扣押。待案件处理结束后，若手机不再作为证据需要留存，且与案件无关的部分得以确认，那么应归还给犯人。但若手机整体被认定为涉案物品，则可能不会归还。
法律建议：
- 对于犯人而言，若认为自己的手机与案件无关，应在刑满释放时向相关部门提出归还请求，并配合提供必要的证明材料。
- 若相关部门拒绝归还手机，犯人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 若相关部门未依法归还与案件无关的手机，可能构成违法扣押，犯人有权要求相关部门承担相应的法律责任。
- 若手机被错误没收或继续扣押，犯人可以通过法律途径寻求救济，包括要求赔偿损失等。
综上所述，犯人刑满释放后手机是否会归还，取决于手机与案件的关联性。若与案件无关，应依法归还；若与案件有关，则可能根据案件处理情况决定是否归还。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。