针对您提出的“行政案件超过诉讼时效法院如何处理”这一问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，行政诉讼时效是由国家法律明确规定的，它旨在保障当事人有权通过行政诉讼程序维护自身合法权益的合理期限。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条的规定，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出，法律另有规定的除外。对于因不动产提起诉讼的案件，自行政行为作出之日起超过二十年，或者其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院将不予受理。
当行政案件超过诉讼时效时，法院的处理方式通常如下：
不予受理：如果原告在超过法定诉讼时效后向法院提起诉讼，且没有提供合理的理由说明为何逾期，那么法院将依法不予受理该案件。这是因为，诉讼时效的设定就是为了促使当事人及时行使权利，避免法律关系的长期不确定状态。
驳回起诉：对于已经受理的案件，如果法院在审理过程中发现原告已超过法定诉讼时效，且没有充足的合理理由进行解释，那么法院将依据相关法规裁定驳回起诉。这意味着，即使案件已经进入了诉讼程序，但由于超过了诉讼时效，原告也将失去胜诉权。
然而，也需要特别指出的是，有时候可能出现时效中断或中止的特殊情况。例如，由于不可抗力因素（如自然灾害、战争等）或者其他非自身原因（如被行政机关非法限制人身自由等）导致起诉期限被耽误的，那么被耽误的这段时间将不会计入起诉期限之内。对于因为特殊情况而耽误起诉期限的，在相关障碍得以排除后的合理期限内（通常是十个工作日内，但具体可能因地区或案件性质而异），当事人可以提出延长起诉期限的申请，最终由人民法院进行裁决。
综上所述，行政案件超过诉讼时效后，法院通常会不予受理或驳回已受理的案件。因此，当事人在提起行政诉讼时，必须高度重视时效问题，确保在法定诉讼时效内行使权利，以获得充分的司法救济。希望这个解答能够帮助您更好地理解行政诉讼时效的相关规定和法院的处理方式。