合同协议书签字但没有盖章，其有效性需根据具体情况综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、合同签字未盖章的一般有效性
签字与盖章的同等法律效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着签字、盖章、按指印在合同成立上具有同等的法律效力。因此，一般情况下，只要合同上有当事人的真实签字，且合同内容不违反法律法规的强制性规定及公序良俗，合同即成立并生效。
真实意思表示：
- 当事人基于真实意愿在合同上签字，即使没有盖章，也视为对合同内容的认可，并愿意受其约束。这是合同法保护当事人意思自治原则的体现。
实际履行的影响：
- 若合同虽未签字盖章但已实际履行，且双方均无异议，那么合同效力不因未签字盖章而受影响。这体现了合同法鼓励交易、保护善意第三人的精神。
二、合同签字未盖章的特殊无效或需注意情况
法律或行政法规的特殊规定：
- 对于某些特定领域或行业的合同，法律可能明确规定必须盖章才生效。例如，涉及不动产交易、金融业务等领域的合同，可能要求必须加盖公章以证明其合法性和有效性。此时，仅签字未盖章的合同可能无效。
当事人的特别约定：
- 如果合同双方在事先明确约定“合同自双方签字且盖章时生效”，则仅签字未盖章的合同不生效。这是尊重当事人意思自治的体现，双方应严格遵守约定。
自然人与法人签订合同的情况：
- 自然人与法人签订的合同，通常要求法人一方加盖公章以证明其身份和授权。若法人未盖章，仅由法定代表人签字，可能因缺乏必要的形式要件而影响合同的效力。但若能证明签字行为是法人的真实意思表示，且合同内容合法，合同仍可能有效。
三、法律建议与风险提示
审查合同条款：
- 在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于合同生效条件、签字盖章要求等关键条款。确保合同内容符合法律法规的规定，并明确双方的权利和义务。
保留证据：
- 在合同签订和履行过程中，应保留好相关证据，如签字样本、盖章记录、合同履行情况等。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。
及时咨询专业律师：
- 如果对合同的效力或履行存在疑问，应及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见，帮助当事人规避风险，维护合法权益。
举例说明：假设甲公司与乙公司签订了一份买卖合同，甲公司代表在合同上签字但未加盖公章。若合同中未明确约定必须盖章才生效，且乙公司对甲公司的签字行为表示认可并接受了货物，那么该合同在法律上通常会被认定为有效。然而，如果合同中明确约定了必须盖章才生效，或者甲公司的签字行为被证明并非其真实意思表示（如存在盗盖、私盖等情况），那么该合同的效力可能会受到影响。
综上所述，合同协议书签字但没有盖章是否有效，需根据合同的具体内容、当事人的真实意思表示、合同的履行情况以及相关法律法规的规定来综合判断。在签订合同时，应谨慎审查合同条款，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。