在交通事故中，若司机受伤且车主与司机并非同一人时，赔偿问题的处理确实需要依据具体情形和法律条款来细致分析。以下是对这一问题的详细解答：

一、明确赔偿关系的基础

首先，我们需要明确司机与车主之间的关系，因为这直接影响到赔偿责任的划分。常见的关系包括雇佣关系、借用/租赁关系、司机与车主为同一人，以及司机在执行单位工作任务时发生事故。

二、不同关系下的赔偿原则

1. 雇佣关系：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十二条，如果司机是在从事雇佣活动中受伤，那么车主（作为雇主）应当承担赔偿责任。这包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。
   • 如果事故是由第三方的行为造成的，司机有权请求第三人承担侵权责任，同时也有权请求车主给予补偿。车主在补偿后，可以向第三人追偿。

2. 借用、租赁关系：

   • 如果车主与司机之间是借用或租赁关系，且车主对损害的发生没有过错（例如车辆没有安全隐患，司机有合法的驾驶资格），那么车主通常不承担赔偿责任。
   • 但是，如果车主知道或者应当知道驾驶人无驾驶资格或者未取得相应驾驶资格，或者车辆存在安全隐患等，仍然将车辆出借或出租给司机，那么车主需要根据其过错程度承担相应的赔偿责任。

3. 司机与车主为同一人：

   • 在这种情况下，不存在车主对司机的赔偿问题。如果事故是由对方车辆的过错导致的，那么司机可以向对方车辆及其保险公司索赔。

4. 执行单位工作任务：

   • 如果司机是在执行单位的工作任务时受伤，那么这通常被视为工伤。根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条，用人单位应当承担侵权责任。同时，司机还可以享受工伤保险待遇，由用人单位和工伤保险基金支付相应的费用。
   • 如果事故是由第三方的行为造成的，司机还可以向第三方主张侵权赔偿，即获得双重赔偿。

三、保险赔偿的作用

在交通事故中，保险赔偿也起着重要的作用。交强险（机动车交通事故责任强制保险）主要用于赔偿第三方的人身伤亡和财产损失，但在某些情况下也可能涉及车上人员的赔付。商业险中的车上人员责任险则专门用于赔偿车上人员在交通事故中的伤害。

四、法律程序与争议解决

如果赔偿问题无法通过协商解决，受伤司机可以依法提起诉讼，要求相关方承担赔偿责任。在诉讼过程中，专业律师的介入将有助于维护司机的合法权益。同时，也可以寻求交警部门或人民调解委员会的调解来协助解决争议。

五、总结与建议

交通事故中司机受伤的赔偿问题复杂多变，需要综合考虑多种因素。建议受伤司机在发生事故后及时咨询专业律师或保险机构，以明确自己的权益和赔偿途径。同时，也提醒所有车主和司机加强交通安全意识，遵守交通规则，共同减少交通事故的发生。