结论前置：土地转让协议约定六十年期限，其法律效力需结合具体情况判断。若涉及农村土地承包经营权转让，则因超出承包期剩余期限而无效；若涉及其他类型土地使用权转让，则需根据相关法律法规及合同约定综合判断。
一、农村土地承包经营权转让的期限限制
法律依据：
- 根据《农村土地承包法》的相关规定，农村土地承包经营权的转让需遵循法定程序，且转让期限不得超过承包期的剩余期限。农村土地承包期通常为三十年，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年。因此，若土地转让协议约定六十年期限，且该土地为农村承包地，则因超出承包期剩余期限而无效。
无效后果：
- 转让协议无效后，双方应恢复原状，即转让方收回土地，受让方返还土地并可能需承担因无效协议造成的损失赔偿责任。
二、其他类型土地使用权转让的期限判断
国有土地使用权转让：
- 若涉及国有土地使用权转让，则需根据《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》等相关法律法规判断。国有土地使用权出让的最高年限因土地用途而异，如居住用地为七十年，工业用地为五十年等。若土地转让协议约定的六十年期限未超过该土地用途的最高出让年限，且符合其他法定条件，则协议可能有效。
集体建设用地使用权转让：
- 对于集体建设用地使用权转让，其期限和效力需根据地方性法规和政策判断。不同地区对集体建设用地使用权转让的规定可能存在差异，因此需具体分析。
三、土地转让协议有效的共同条件
无论涉及何种类型的土地使用权转让，土地转让协议要有效，通常需满足以下条件：
- 双方协商一致：转让协议必须是双方自愿、平等协商的结果，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 遵循法定程序：转让方需具备转让资格，经相关权利人同意（如发包方、国有土地所有权人等），并与受让方签订书面转让合同。
- 符合法律规定：协议内容不得违反法律的强制性规定，如不能转让土地所有权（土地所有权属于国家或集体所有）。
- 符合土地用途：流转的土地必须用于合法用途，不得改变土地的农业用途属性（如农村承包地）或违反城市规划等。
四、实践建议
- 审查土地性质和承包期限：在签订土地转让协议前，务必审查土地的性质（如农村承包地、国有土地、集体建设用地等）和承包期限，确保转让期限不超出法定限制。
- 签订书面协议并办理变更登记：为避免纠纷，双方应签订书面的土地转让协议，并明确双方的权利和义务。转让完成后，应及时到相关部门办理土地变更登记手续。
- 咨询专业律师：土地转让涉及复杂的法律关系和程序，建议在签订转让协议前咨询专业律师，确保协议内容的合法性和有效性。
五、可能面临的法律后果
若土地转让协议因期限超出法定限制或其他原因而无效，双方可能面临以下法律后果：
- 恢复原状：转让方收回土地，受让方返还土地。
- 损失赔偿：因无效协议造成的损失，双方可能需根据过错程度承担赔偿责任。
- 行政处罚：若转让行为违反土地管理法规，可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
综上所述，土地转让协议约定六十年期限的法律效力需结合具体情况判断。在涉及土地转让时，建议务必谨慎对待，确保协议内容的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。