机械式立体停车库工程施工合同纠纷，一般可定为“建设工程施工合同纠纷”案由。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、案由确定的基本原则
在确定合同纠纷的案由时，我们首先要考虑的是合同的主要内容和性质。机械式立体停车库工程施工合同，本质上属于建设工程施工合同的一种，因为它涉及到了停车库的设计、施工、安装等环节，这些环节都是建设工程施工合同中常见的要素。因此，从合同的主要内容和性质出发，我们可以初步确定该纠纷的案由为“建设工程施工合同纠纷”。
二、案由确定的具体依据
合同内容：机械式立体停车库工程施工合同通常包含了停车库的设计、施工、安装、调试等条款，这些条款与建设工程施工合同的内容高度相似。因此，根据合同内容，我们可以将该纠纷归类为建设工程施工合同纠纷。
法律规定：根据《中华人民共和国民法典》中关于建设工程合同的规定，建设工程施工合同是指承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。机械式立体停车库工程施工合同符合这一定义，因此可以适用相关法律规定。
司法实践：在司法实践中，类似机械式立体停车库工程施工合同的纠纷，通常都被归类为建设工程施工合同纠纷进行审理。这为我们确定案由提供了实践参考。
三、可能涉及的特殊问题
虽然机械式立体停车库工程施工合同纠纷一般可定为“建设工程施工合同纠纷”案由，但在实际处理过程中，我们还需要注意一些特殊问题：
合同条款的特殊性：机械式立体停车库工程施工合同可能包含一些特殊的条款，如停车设备的选型、安装标准等。这些条款可能对纠纷的处理产生影响，但并不改变纠纷的基本性质。
技术标准的适用：在处理机械式立体停车库工程施工合同纠纷时，可能需要适用相关的技术标准。这些技术标准可能涉及停车设备的性能、安全等方面，对纠纷的处理具有重要影响。但同样，这些技术标准的适用并不改变纠纷属于建设工程施工合同纠纷的性质。
四、法律建议
明确合同条款：在签订机械式立体停车库工程施工合同时，双方应明确合同条款，特别是关于工程范围、质量标准、付款方式等关键条款。这有助于减少纠纷的发生，并在纠纷发生时提供明确的依据。
保留相关证据：在合同履行过程中，双方应保留好相关证据，如施工记录、验收报告、付款凭证等。这些证据在纠纷处理过程中可能起到关键作用。
及时寻求法律帮助：如果发生机械式立体停车库工程施工合同纠纷，双方应及时寻求法律帮助，通过合法途径解决纠纷。作为专业律师，我可以为你提供全面的法律咨询和代理服务。
综上所述，机械式立体停车库工程施工合同纠纷一般可定为“建设工程施工合同纠纷”案由。在处理此类纠纷时，我们应明确合同条款、保留相关证据，并及时寻求法律帮助。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。