将房子通过公证书转给儿子，在法律上是有效的。以下从不同角度为您详细分析：

公证书的法律效力

公证书是由国家公证机构根据当事人的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。在房产转让中，如果通过公证书对房产转让行为进行了公证，那么这份公证书就具有了法律上的证明力，可以确认房产转让行为的真实性和合法性。

房产转让的合法性

1. 自愿转让：房产转让必须是双方自愿的行为，不存在欺诈、胁迫等情形。如果通过公证书对自愿转让的行为进行了确认，那么这份公证书就是房产转让合法性的有力证据。
2. 符合法律规定：房产转让必须符合相关的法律规定，如《民法典》中关于物权变动的规定。如果房产转让行为本身违反了法律规定，那么即使有公证书，也可能被认定为无效。但在此情况下，我们讨论的是房产转让行为本身合法，且通过公证书进行了确认。
3. 办理过户手续：虽然公证书可以证明房产转让行为的真实性和合法性，但要想真正完成房产的转让，还需要办理相关的过户手续。过户手续是房产转让的法定程序，只有办理了过户手续，房产的所有权才会发生转移。不过，公证书可以作为办理过户手续的重要依据。

实际操作中的注意事项

1. 确保公证书的真实性和合法性：在办理公证书时，要确保公证机构的合法性和公证程序的正当性。如果公证书存在瑕疵或违法情形，可能会影响其法律效力。
2. 及时办理过户手续：虽然公证书具有法律效力，但房产的所有权转移还需要通过过户手续来完成。因此，在办理完公证书后，要及时办理过户手续，以确保房产的所有权能够顺利转移。
3. 考虑税费问题：在房产转让过程中，还需要考虑相关的税费问题。根据税法的规定，房产转让可能需要缴纳契税、个人所得税等税费。在办理房产转让时，要了解并遵守相关的税费规定。

可能的法律后果

如果房产转让行为本身合法，且通过公证书进行了确认，但未办理过户手续，那么在法律上，房产的所有权仍然属于原所有人。不过，在这种情况下，如果原所有人反悔或出现其他纠纷，公证书可以作为证明房产转让行为真实性和合法性的重要证据。

建议您：在办理房产转让时，除了办理公证书外，还要及时办理过户手续，并了解相关的税费规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。