违章建筑的认定主体主要依据建设活动发生的地点及所涉及的法律法规来确定，通常包括城乡规划主管部门、乡（镇）人民政府以及自然资源部门。以下是对这一问题的详细分析：

1. 城乡规划主管部门：

   • 适用范围：主要负责城市、镇规划区内建筑物、构筑物等工程建设的违章建筑认定。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，对于未取得或违反建设工程规划许可证的建设行为，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门有权责令停止建设、限期改正、罚款、拆除或没收实物及违法收入。
   • 实例说明：例如，某市市区内开发商未经规划许可擅自超建楼层，城乡规划主管部门即有权对此进行违章建筑认定。

2. 乡（镇）人民政府：

   • 适用范围：负责乡、村庄规划区内未依法取得或违反乡村建设规划许可证的建设行为的违章建筑认定。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，乡、镇人民政府对违反乡村建设规划的建设行为有权责令停止建设、限期改正，逾期不改正的可拆除。
   • 实例说明：若某村庄村民未经许可在村集体土地上新建房屋，乡（镇）人民政府则有权对该房屋进行违章建筑认定。

3. 自然资源部门：

   • 适用范围：主要涉及土地使用方面的违法建设认定，如未经批准非法占用土地进行建设等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，对于非法占用土地或违反土地利用总体规划的建设行为，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令退还土地、限期拆除、恢复土地原状或没收建筑物并处罚款。
   • 实例说明：如某企业未经批准占用农用地建设厂房，自然资源部门即可认定该厂房为违章建筑。

综合建议：

• 在不同地区，具体负责违章建筑认定的部门可能有所差异。因此，在面临相关问题时，建议结合当地实际情况咨询相关部门以获取准确信息。
• 建设者在进行任何建设活动前，应充分了解并遵守相关法律法规，确保取得必要的许可和批准。这样可以避免被认定为违章建筑而面临罚款、拆除等法律后果。

如果您在房产领域遇到任何法律问题，特别是关于违章建筑认定、处理等方面的疑问，欢迎直接向我咨询。我将以专业的知识和丰富的经验，为您提供全面、准确的法律解答。