针对您提出的“机动车交通事故保险公司申请三期鉴定支付的鉴定费法院判谁承担”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
在机动车交通事故中，涉及三期鉴定（误工期、护理期、营养期鉴定）的费用承担问题，通常遵循“谁主张，谁垫付，最终由责任方承担”的原则。具体来说，费用的承担需根据事故责任认定、保险合同约定及具体情况综合判断。
一、一般情况下的费用承担
申请方垫付原则：
- 在交通事故处理过程中，三期鉴定费用通常由申请鉴定的一方先行垫付。这包括伤者、机动车驾驶人或保险公司等申请方。
责任方承担原则：
- 若事故责任认定一方负全部责任，则该方承担三期鉴定费用。
- 若双方都有责任，则按责任比例分担鉴定费用。例如，主要责任方承担大部分费用，次要责任方承担小部分。
二、特殊情况下的费用承担
保险公司承担：
- 交强险范围内：保险公司应在交强险责任限额内赔偿三期鉴定费用（如果属于赔偿项目和限额内）。
- 商业三者险范围内：根据保险合同约定，保险公司在交强险赔偿不足的部分按责任比例赔偿，可能包括三期鉴定费用。但具体是否赔偿及赔偿比例需依据保险合同条款。
受害人自身原因：
- 若因受害人拒绝配合鉴定等自身原因导致费用产生，费用由受害人自行承担。
重新鉴定：
- 若责任方对鉴定结果有异议并申请重新鉴定，重新鉴定的费用由申请方先行垫付。
- 若重新鉴定结果改变原鉴定结论，费用通常由原鉴定方承担；若未改变，则由申请方承担。
法院依职权委托：
- 法院根据案件审理需要依职权委托进行的三期鉴定，费用由法院根据案件具体情况决定承担方。
三、诉讼中的费用承担
- 若双方无法协商一致，通过诉讼解决纠纷，三期鉴定费用的承担将根据诉讼结果确定。
- 若伤者主张得到法院支持，鉴定费用一般由责任方或其保险公司承担。
- 若伤者主张未得到支持，如鉴定结论不被采信或存在故意扩大损失情形，伤者可能需要自行承担费用。
四、建议
- 在处理交通事故涉及的三期鉴定费用问题时，应遵循公平、合理的原则，并尽量通过协商解决纠纷。
- 若对鉴定结果或费用承担有异议，应及时咨询专业律师或通过法律途径解决，以保障当事人的合法权益。
- 在进行三期鉴定前，建议明确费用支付方式和标准，并保留好相关票据，以便在后续维权过程中使用。
综上所述，机动车交通事故中三期鉴定费用的承担需根据事故责任认定、保险合同约定及具体情况综合判断。在无法协商一致的情况下，可通过诉讼途径解决，并由法院根据具体情况判决费用承担方。