民营企业使用软件著作权（软著）进行实缴是合法的，但能否在相关网站上查询到则取决于数据同步和平台展示的情况。以下是对这一问题的详细分析：

软著实缴的合法性

1. 法律依据：

   • 根据《公司法》及相关规定，股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。软件著作权作为知识产权的一种，具有财产属性，因此可以用于实缴出资。

2. 实缴流程：

   • 民营企业若选择使用软著进行实缴，需确保软著的权属清晰，无争议，并依法进行评估作价。
   • 评估作价后，需将软著过户至公司名下，并完成相关的出资手续，如修改公司章程、办理工商变更登记等。

网站查询不到的原因及解决方案

1. 数据同步时效：

   • 天眼查、企查查等平台通过版权局接口获取数据，通常需在证书发放后3-7个工作日完成同步。若刚获得软著证书，请耐心等待数日再查询。

2. 信息缺失原因：

   • 平台数据更新延迟：平台可能因技术原因或数据量过大导致更新延迟。
   • 接口未抓取该条记录：平台接口可能未完全抓取所有软著信息。
   • 企业名称差异：软著申请填写的企业名称与查询时使用的名称存在差异（如缩写、笔误等）。
   • 企业选择不公开：部分平台仅公示公开数据，若企业选择不公开著作权信息，则无法查询到。

3. 官方核验渠道：

   • 若平台未显示软著信息，可通过以下方式直接确认：
     • 访问中国版权保护中心官网，输入登记号、著作权人或软件名称进行查询。
     • 致电版权中心客服（如400-890-3660）进行人工核查。

法律建议

1. 确保软著权属清晰：

   • 在使用软著进行实缴前，务必确认软著的权属清晰，无争议，避免后续产生法律纠纷。

2. 依法进行评估作价：

   • 软著的评估作价需符合市场行情，避免过高或过低评估导致出资不实。

3. 及时办理出资手续：

   • 完成软著过户和评估作价后，需及时办理相关的出资手续，确保实缴出资的合法性和有效性。

4. 关注平台查询结果：

   • 若在平台查询不到软著信息，不要急于下结论，可通过官方核验渠道进行确认。

若您在使用软著进行实缴过程中遇到任何法律问题，或对查询结果有疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。