水务局内设股室不具有独立法人资格。以下是对此结论的详细解释：

1. 法人资格的定义：

   • 法人资格是指法律上赋予一个组织或单位以独立享有民事权利和承担民事义务的能力。这种能力使得法人能够以其自己的名义进行法律活动，如签订合同、拥有财产、提起诉讼等。

2. 水务局内设股室的性质：

   • 水务局内设股室是水务局内部的一个组成部分，它并不具备独立的法律地位。其存在和运作都是基于水务局的授权和安排，没有独立的财产权、人事权和决策权。

3. 法人资格的判定：

   • 根据我国法律的相关规定，一个组织或单位要取得法人资格，通常需要经过一定的登记或审批程序，并获得相应的法人证书。而水务局内设股室并没有这样的登记或审批程序，也没有法人证书。

4. 实际运作中的体现：

   • 在实际运作中，水务局内设股室通常是以水务局的名义进行活动，如签订合同、处理事务等。其行为的法律后果也是由水务局来承担，而不是由内设股室自身承担。

综上所述，水务局内设股室由于其性质、法律地位和实际运作方式等方面的原因，并不具备独立法人资格。因此，在涉及法律事务时，应以水务局作为法律主体来进行处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。