房屋被强拆时，应起诉的部门通常是市、县级人民政府确定的房屋征收部门，该部门在行政诉讼中作为被告。以下是详细的法律分析和建议：
一、法律依据
根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第四条，市、县级人民政府负责本行政区域的房屋征收与补偿工作，并确定房屋征收部门来组织实施。这意味着，房屋征收部门是具体执行拆迁任务的机构，若其行为违法，如强拆，则应承担相应的法律责任。
二、起诉对象的选择
房屋征收部门：
- 这是最直接的起诉对象，因为房屋征收部门是具体执行拆迁任务的机构。若其未经合法程序进行强拆，侵犯了您的合法权益，您可以向人民法院提起行政诉讼，要求确认强拆行为违法并赔偿损失。
其他可能涉及的责任主体：
- 实施强拆的单位或个人：如果强拆行为是由其他单位或个人直接实施的，且该行为未经房屋征收部门委托或授权，那么这些单位或个人也可能成为被告。
- 上级政府或相关部门：在某些情况下，如果强拆行为背后存在上级政府或相关部门的指示或默许，且这些指示或默许违反了法律规定，那么上级政府或相关部门也可能承担一定的法律责任。但这种情况较为复杂，需要具体分析。
三、起诉前的准备
收集证据：
- 包括强拆现场的照片、视频、拆迁通知、房屋权属证明等。这些证据将有助于证明强拆行为的存在以及您房屋的合法性。
了解法律程序：
- 熟悉《国有土地上房屋征收与补偿条例》、《行政强制法》等相关法规，明确自身权利以及起诉的流程和要求。
咨询专业律师：
- 虽然我作为王晓芳律师已经给出了专业的法律建议，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，在起诉前咨询一位专业律师，根据您的具体情况制定合适的诉讼策略，仍然是非常必要的。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会尽力为您提供帮助。
四、起诉后的可能结果
确认强拆行为违法：
- 如果法院认定强拆行为违法，那么您将有权要求赔偿损失，包括房屋价值、搬迁费用、临时安置费用等。
驳回起诉或判决不承担责任：
- 如果法院认为强拆行为合法或您未能提供足够的证据证明强拆行为违法，那么您的起诉可能会被驳回或法院判决不承担责任。但这种情况较为少见，只要您能提供充分的证据并遵循法律程序，通常都能获得公正的判决。
五、其他维权途径
除了起诉外，您还可以考虑以下维权途径：
向相关部门投诉：
- 如向公安机关报案，要求查处强拆行为中的违法犯罪行为；向自然资源与规划部门、住房和城乡建设部门等投诉，要求查处非法占地、违规建设等问题。
申请行政复议：
- 如果您认为房屋征收部门的强拆行为违反了法律规定，且尚未提起行政诉讼，那么您可以向上一级政府或相关部门申请行政复议，要求撤销或变更原行政行为。
媒体曝光与网络维权：
- 在合法合规的前提下，通过媒体曝光或网络平台发声，引发社会关注，促使问题得到重视和解决。但这种方式应谨慎使用，避免侵犯他人权益或违反法律法规。
最后，我建议您在面对房屋被强拆的情况时，保持冷静和理性，依法依规主张自己的诉求。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。