公务员超休了5天，首先需要明确的是，这通常涉及到公务员的休假制度以及单位的具体管理规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、休假制度与单位规定

1. 休假制度：公务员的休假通常遵循国家的相关规定，如年假、病假、事假等。每种假期的天数和申请流程都有明确的规定。超休可能意味着公务员未按照规定的流程或天数申请休假。

2. 单位规定：除了国家层面的休假制度外，各单位还可能根据自身情况制定具体的休假管理规定。这些规定可能包括超休的处理方式、扣减工资或奖金的标准等。

二、超休的可能后果

1. 扣减工资或奖金：根据单位的规定，超休的公务员可能会面临工资或奖金的扣减。这是最常见的处理方式，旨在通过经济手段约束公务员的休假行为。

2. 纪律处分：对于严重超休或多次超休的公务员，单位可能会给予纪律处分，如警告、记过等。这取决于超休的严重程度以及单位的管理政策。

3. 影响晋升与评优：超休行为可能会影响公务员的晋升和评优。在晋升和评优过程中，单位通常会考虑公务员的工作表现、纪律遵守情况等因素。

三、应对建议

1. 了解单位规定：首先，公务员应详细了解自己所在单位的休假管理规定，明确超休的处理方式和后果。

2. 及时沟通与解释：如果因特殊原因确实需要超休，公务员应及时与单位沟通并解释原因。在沟通时，应提供充分的证据和理由，以争取单位的理解和支持。

3. 遵守规定与纪律：最重要的是，公务员应严格遵守休假制度和单位规定，合理安排休假时间，避免超休行为的发生。

四、特殊情况处理

如果超休是由于不可抗力因素（如突发疾病、家庭紧急情况等）导致的，公务员应及时向单位报告并提供相关证明。在这种情况下，单位可能会根据实际情况给予一定的理解和宽容，但具体处理方式仍需遵循单位的规定。