在土地侵权案件中，要证明被告是谁，需要从多个方面进行综合考量，以下是一些详细的步骤和建议：

一、明确纠纷性质

首先，需要明确土地纠纷的具体性质，是土地所有权纠纷、土地使用权纠纷，还是其他与土地相关的纠纷。不同性质的纠纷，涉及的被告主体可能截然不同。例如，如果是土地所有权纠纷，那么被告可能是声称拥有该土地所有权的另一方；如果是土地使用权纠纷，被告则可能是未经许可占用或使用该土地的一方。

二、审查原告主张

在起诉时，原告会明确指出其认为侵犯了其土地权益的相对方。这是初步确定被告的重要依据。原告需要提供充分的证据来支持其主张，比如土地权属证书、土地使用协议、现场照片或视频等，以证明被告确实存在侵权行为。

三、查看土地权属来源

土地权属的来源是判断被告的关键因素之一。如果纠纷是因土地出让、划拨等合同引发的，那么合同相对方通常是被告。例如，如果原告认为其土地被非法出让给了某公司，那么该公司就是被告。如果纠纷涉及继承等导致土地权属变化的情况，相关继承人等可能成为被告。

四、考虑实际占有使用情况

实际占有使用土地的一方，如果被指行为侵害了他人权益，可能成为被告。例如，如果未经许可占用他人土地的一方被起诉，那么该占用方就是被告。在这种情况下，原告需要提供证据证明被告确实占用了其土地，并且这种占用是未经许可的。

五、关注土地流转环节

在土地流转过程中，如转包、出租等出现纠纷，参与流转的各方根据具体情况可能成为被告。例如，如果未按约定履行流转合同义务的一方被起诉，那么该方就是被告。在这种情况下，原告需要提供流转合同、支付凭证等证据来证明被告确实存在违约行为。

六、审查相关行政行为

如果土地纠纷与政府部门的行政确权、审批等行为有关，那么作出该行政行为的部门或相关责任人也可能被列为被告。例如，如果原告认为政府部门的土地确权决定错误，导致其土地权益受损，那么该政府部门就是被告。在这种情况下，原告需要提供行政决定书、复议决定书等证据来证明其主张。

七、综合证据与法律分析

在确定了可能的被告后，原告需要收集并整理相关证据，包括书面证据、物证、证人证言等，以证明被告确实存在侵权行为。同时，原告还需要对相关法律法规进行深入分析，以确定其主张的法律依据和合理性。

八、寻求专业法律帮助

由于土地侵权案件往往涉及复杂的法律关系和证据收集问题，因此建议原告在起诉前寻求专业法律帮助。律师可以协助原告分析案情、收集证据、制定诉讼策略等，从而提高原告的胜诉几率。

综上所述，证明土地侵权案件中的被告是谁需要从多个方面进行综合考量，并收集充分的证据来支持其主张。希望这些建议能对您有所帮助。