结论：摩托车因违章被警察扣车，后续消除处理时是否需要缴纳罚款，需根据具体违章情形及法律规定来判断，以下分情况说明：

1. 若违章行为明确规定需罚款
   根据《道路交通安全法》及相关实施条例，部分摩托车违章行为（如无证驾驶、超速、闯红灯、未悬挂号牌等）在处罚时，扣车与罚款通常是并行措施。即使警察现场未开具罚款单，后续处理时仍可能要求缴纳罚款。例如：

   • 无证驾驶：依据《道路交通安全法》第九十九条，可处200元以上2000元以下罚款；
     
   • 未悬挂号牌：依据第九十五条，可处警告或20元以上200元以下罚款。
     此类情况下，消除违章记录（如取回车辆）前，需先完成罚款缴纳及可能的其他处罚（如扣分）。

2. 若违章行为仅规定扣车或其他处罚
   少数违章行为可能仅以扣车作为处罚手段，无需额外罚款。例如：

   • 车辆存在严重安全隐患（如刹车失灵），警察可依法扣留车辆直至隐患消除，但无需罚款；
     
   • 车辆被用于非法活动（如盗窃），扣车后可能移交其他部门处理，罚款与否取决于后续调查结果。
     但此类情形较少，需结合具体违章事实判断。

3. 若警察现场未开具罚款单，后续处理流程
   即使警察现场未直接开具罚款单，扣车后通常需到指定地点（如交警队）接受处理。此时：

   • 交警会核实违章事实，并依据法律规定决定是否罚款；
     
   • 若需罚款，会出具《行政处罚决定书》，明确罚款金额及缴纳期限；
     
   • 缴纳罚款后，方可办理车辆放行手续。
     若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

建议：

• 尽快携带行驶证、驾驶证等相关证件到交警部门接受处理，避免因拖延产生滞纳金（如罚款未在15日内缴纳，每日按3%加收）；
  
• 处理时要求交警明确处罚依据，若认为处罚不当，可当场提出异议或后续通过法律途径解决。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体违章情形及应对措施。