结论前置：分居期间偷走建房合同的行为，可能涉及民事侵权、违反夫妻共同财产管理义务，甚至可能触犯刑法中的盗窃罪或侵占罪，具体处理方式需结合行为性质、合同价值及主观意图综合判断。以下是分情况说明：

1. 若合同属于夫妻共同财产相关文件，且偷走行为旨在独占财产利益

• 民事层面：建房合同若涉及夫妻共同出资建造的房屋，属于夫妻共同财产。一方未经对方同意私自藏匿、转移合同，可能构成对共同财产管理权的侵犯。根据《民法典》第1062条，夫妻对共同财产有平等的处理权，擅自处置可能被认定为无效行为。
  处理建议：可通过协商要求返还合同，或向法院提起“夫妻共同财产分割纠纷”诉讼，主张对方返还合同并赔偿损失（如因合同缺失导致的建房延误、成本增加等）。
• 刑事层面：若偷走合同的目的系通过隐匿财产信息，在离婚时独占房屋权益，且合同价值较高（如涉及房产价值巨大），可能涉嫌《刑法》第264条的“盗窃罪”（以非法占有为目的，秘密窃取财物）。但需注意，盗窃罪通常针对有形财物，合同作为权利凭证是否构成“财物”存在争议，实践中更可能以“侵占罪”或“民事侵权”处理。

2. 若合同涉及一方个人财产（如婚前个人出资建房），偷走行为可能构成侵占

• 民事层面：若建房资金为一方婚前个人财产，合同虽在婚后签署，但房屋可能被认定为个人财产（需结合出资证明、产权登记等）。此时，另一方偷走合同可能构成对个人财产的侵占。
  处理建议：可要求对方返还合同，若对方拒不返还，可向法院提起“返还原物纠纷”诉讼，主张对方归还合同并赔偿因侵占导致的损失（如补办合同的费用）。
• 刑事层面：若合同价值较高（如涉及商业建房项目），且对方以非法占有为目的，拒不返还，可能涉嫌《刑法》第270条的“侵占罪”（将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大）。但需注意，侵占罪系自诉案件，需由受害人直接向法院起诉。

3. 若偷走合同行为伴随其他违法行为（如伪造、篡改合同内容）

• 民事层面：若对方偷走合同后伪造、篡改内容（如修改产权比例、建房成本等），可能构成《民法典》第154条的“恶意串通损害他人权益”，相关条款无效。
  处理建议：可向法院提起“确认合同无效纠纷”诉讼，要求撤销被篡改的合同，并追究对方伪造证据的法律责任（如赔偿损失、罚款等）。
• 刑事层面：伪造、篡改合同可能涉嫌《刑法》第280条的“伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪”（若合同需加盖印章）或“诈骗罪”（若以伪造合同骗取财物）。但需结合具体行为和后果判断是否达到刑事立案标准。

综合建议

1. 固定证据：立即保存合同被偷走的证据（如监控录像、对方承认偷走合同的聊天记录、证人证言等），以及合同相关的建房出资证明、产权登记信息等。
2. 协商解决：优先与对方沟通，要求返还合同并说明法律后果（如可能承担民事赔偿或刑事责任）。
3. 法律途径：若协商无果，可根据行为性质选择民事诉讼（返还合同、赔偿损失）或刑事自诉（侵占罪），必要时向公安机关报案（如涉嫌盗窃或诈骗）。

提示：分居期间处理财产问题需谨慎，避免因情绪化行为导致法律风险升级。如有具体证据或细节需进一步分析，可直接向我咨询。