双方自签合同房屋两年后过户在法律上是可行的，但需要注意一些风险和细节。

从法律角度来看，买卖双方完全可以在买房协议中约定两年后再办理过户手续。只要这一约定是双方的真实意思表示，并且不违反法律法规的强制性规定，那么这份协议就是有效的。双方都应该按照协议中的约定来履行各自的义务。

然而，这种做法确实存在一些风险。对于买方来说，最大的风险在于，在未办理过户之前，房屋的产权仍然属于卖方。这意味着卖方有可能在这段时间内将房屋再次出售或抵押给他人，导致买方虽然可以依据协议追究卖方的违约责任，但可能面临无法取得房屋的困境。对于卖方而言，如果这两年间房屋的市场价值大幅上涨，可能会产生违约的冲动。

此外，政策变化也是一个需要考虑的因素。比如限购政策的调整等，都可能影响到过户的顺利进行。

因此，如果双方选择签买房协议后两年再过户，建议在协议中明确约定违约责任等条款，以保障双方的权益。同时，买方也应该在这段时间内密切关注房屋的产权状况，确保没有出现抵押、查封等情况。

总的来说，双方自签合同房屋两年后过户是可行的，但需要谨慎对待，确保充分了解并考虑到所有可能的风险和因素。如果有任何疑问或担忧，建议咨询专业的法律人士或房产中介。